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  • scRNA---Day12

    再了解單細(xì)胞測序之“小澤看文獻(xiàn)”原文作者:劉小澤鏈接:http://www.reibang.com/p/f916ff91d107 生物學(xué)背景很...

  • scRNA---Day11(monocle)

    pData()函數(shù)Retrieve information on experimental phenotypes recorded in eSe...

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    scRNA---Day10(Seurat3.0)

    更換數(shù)據(jù)集跑Seurat流程(smartseq2)幾個函數(shù)1. DimPlot():Graphs the output of a dimensi...

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    scRNA---Day9(Seurat)

    Seurat安裝想要安裝舊版本(目前是3.X裆操,與2.X有較大差別) Seurat2.X與Seurat3.X妄圖切換(湊字?jǐn)?shù)警告凯正,并沒有成功棒拂,我安...

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    scRNA---Day8(scater)

    續(xù)昨 可視化: 按示例數(shù)據(jù)選取前6個基因逊躁,一般實驗中選取marker基因: 降維 runPCA() t-distributed stochast...

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    scRNA---Day7(scater)

    跟著官網(wǎng)說明學(xué)習(xí)scater包 introductionscater contains tools to help with the analy...

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    scRNA---Day6

    cell cycle 細(xì)胞周期相關(guān)的包:https://mp.weixin.qq.com/s/nFSa5hXuKHrGu_othopbWQlib...

  • scRNA---Day5

    幾個知識點:External RNA Controls Consortium (ERCC) :(旨在尋找)通用的RNA參考物治泥,在基因表達(dá)定量時可...

  • scRNA---Day4

    續(xù)昨 par()函數(shù) Graphical Parameters:par can be used to set or query graphica...

  • scRNA---Day2

    補充知識點: 主成分分析 主要用途在于降維,析出主成分的顯著差異助泽,削減/去除回歸分析和聚類分析中的次要因素及包含于內(nèi)的變量princomp()R...

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