前面由于對miRNA的探針數(shù)目沒有正確的理解，以為數(shù)據(jù)一直沒有下載完全军浆，折騰了一番凳干。后來經(jīng)老大jimmy提醒了，miRNA有2000左右的探針就...
投稿
收錄了30篇文章 · 25人關(guān)注
-
一篇WGCNA文章復(fù)現(xiàn)-GSE85589-下集
-
bilibili視頻-《生信人應(yīng)該這樣學(xué)R語言》-P13-R語言作業(yè)-中級R語言小作業(yè)-中級 1.請根據(jù)R包org.Hs.eg.db找到下面ensembl 基因ID 對應(yīng)的基因名(symbol) ENSG0000000...
-
非常詳細(xì)的GEO數(shù)據(jù)下載和清理凭涂，你要看嗎-GSE33532
來自數(shù)據(jù)集GSE33532,對于第一步獲得表達(dá)矩陣祝辣，做了還蠻詳盡的注解過程，希望能對其他人有幫助切油。雖然看上去全是黑色代碼快蝙斜，但注解理解示例全在這...
-
公共數(shù)據(jù)庫沒有錯誤嗎？我們對GSE17215進(jìn)行分析 按照原數(shù)據(jù)3X3分組 1.注釋基因澎胡，整理數(shù)據(jù) 2.檢查數(shù)據(jù) 發(fā)現(xiàn)按照3X3分組樣本主成分和聚類孕荠，有一個樣本表現(xiàn)很...
-
典型醫(yī)學(xué)設(shè)計實驗GEO數(shù)據(jù)分析 (step-by-step) - Limma差異分析、火山圖攻谁、功能富集
典型醫(yī)學(xué)設(shè)計實驗GEO數(shù)據(jù)分析 (step-by-step) - 數(shù)據(jù)獲取到標(biāo)準(zhǔn)化介紹了實驗的設(shè)計稚伍、數(shù)據(jù)獲取、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化和注釋戚宦，下面是如何利用L...
-
R語言GEO數(shù)據(jù)挖掘02-解決GEO數(shù)據(jù)中的多個探針對應(yīng)一個基因解決GEO數(shù)據(jù)中的多個探針對應(yīng)一個基因 當(dāng)我們來到這一步時我們默認(rèn)經(jīng)過前期的處理个曙，你已經(jīng)獲得了表達(dá)矩陣的數(shù)據(jù)，獲得了探針的注釋信息受楼。在進(jìn)一步探索...
-
GEO數(shù)據(jù)挖掘系列文-生信技能樹
GEO數(shù)據(jù)挖掘系列文-第一期-膠質(zhì)母細(xì)胞瘤http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTEwODk0Ng==&mi...
-
1.Start-GEO下面這個是在關(guān)于在要下載安裝包之前做的切換鏡像,搜索到http和https有什么區(qū)別 一垦搬、HTTP和HTTPS的基本概念HTTP：是互聯(lián)網(wǎng)上應(yīng)用...
-
公共數(shù)據(jù)庫挖掘之利用R語言下載并整理GEO數(shù)據(jù)因為是初次利用R包進(jìn)行下載數(shù)據(jù)呼寸，其中遇到了各種問題，重裝了幾個R猴贰，終于可以順利下載文件了《匝現(xiàn)在把過程整理總結(jié)如下，其中有問題的地方還希望大家一起...
-
GEO數(shù)據(jù)挖掘小嘗試：（一）尋找共同差異基因在使用Bioconductor 分析芯片數(shù)據(jù)（一）中我們使用的是芯片的原始數(shù)據(jù)（即*.cel文件）進(jìn)行分析米绕，但在大部分情況下我們是可以利用GEO...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1816714/1-140401100533.jpg', '推薦專題《雞易嘔》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.reibang.com/c/90c293920e02?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}