在GWAS研究中绿贞，Manhattan plot和QQ plot是最常畫的兩類圖丝里，它們可以把跟研究的性狀（比如入客，基因型和身高）顯著相關(guān)的基因位點清...

(●ˇ?ˇ●) 函數(shù) layout() 接下來技掏，就可以按照1幔崖，2滋迈，3數(shù)字順序(沒有數(shù)字0)進行畫圖啦罪郊！也就是說畫的第一張圖放在1號位置，第二張圖...

寫在前面：本文為自己在學習過程中看過各類資料后整理做的筆記，純屬方便自己學習以及后期回顧乎折，也希望有幸能幫助到和我一樣的小白們绒疗，各位大神如果發(fā)現(xiàn)有...

最近跑通了一遍GWAS分析骂澄，全程在linux操作吓蘑，雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方，先把代碼整理分享出來mark一下 前期準備 1.理論知識 強烈...

全基因組關(guān)聯(lián)分析是基于數(shù)量性狀連鎖不平衡理論坟冲，通過表型與基因型關(guān)聯(lián)分析獲得影響表型性狀的顯著關(guān)聯(lián)標記磨镶。 1. 軟件 Tassel / Gaipt...

1、GWAS 流程 image.png數(shù)據(jù)質(zhì)控? 1）按分型百分比條件過濾健提，多數(shù)文章剔除缺失率在20%以上的位點琳猫，樣本量較大的群體中，可以將缺失...

1私痹、基本統(tǒng)計學概念 假設(shè)檢驗? 零假設(shè)(H0):即原假設(shè)? 備擇假設(shè)(H1):與零假設(shè)對立的假設(shè)? 計算零假設(shè)(H0)成立的概率? 如果H0成立...