傾向性評(píng)分匹配（propensity score matching, PSM）主要是在隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)(Randomized controlled ...

隨機(jī)森林分析在宏基因組數(shù)據(jù)分析中還是蠻常見的禀酱，所以這里整理一個(gè)常規(guī)的分析案例 1 | 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 1.1 菌群數(shù)據(jù) 1.2 樣品信息數(shù)據(jù) 2 | ...

前言 很多時(shí)候，我們分析完差異表達(dá)基因后竭钝，發(fā)現(xiàn)會(huì)得到一大堆差異基因，常見的做法有降低Pvalue的閾值悯衬，挑選fold-change最大的基因肾扰，做...

我之前寫過一篇文章介紹最近寫的一個(gè)包 ezcox，它可以用來進(jìn)行批量處理 Cox 模型（支持并行計(jì)算）脆荷。那個(gè)時(shí)候我已經(jīng)關(guān)注到了 forestmo...

SMOTE（Synthetic Minority Oversampling Technique）凝垛，合成少數(shù)類過采樣技術(shù)．它是基于隨機(jī)過采樣算法的...

step1 線性回歸ROC與AUC的實(shí)現(xiàn) 這是計(jì)算affair的一個(gè)數(shù)據(jù)集 step2 繪圖強(qiáng)大的一個(gè)包——pROC 雖然ROCR包可以滿足我們...

在機(jī)器學(xué)習(xí)建模過程中懊悯，針對(duì)不同的問題，需采用不同的模型評(píng)估指標(biāo)梦皮。 一炭分、分類模型評(píng)估指標(biāo)： 1、混淆矩陣（Confusion Matrix） 2剑肯、...

TMB背景知識(shí)介紹 免疫療法是近年來腫瘤治療的熱點(diǎn)捧毛，腫瘤突變負(fù)荷(Tumor Mutational Burden，TMB)可以作為免疫療法的bi...