比如,我最近在讀取一個excel表格,里面的數(shù)據(jù)是這樣的衙熔,是代謝物的名稱: 如果我直接讀取的話 那么在R里就會出現(xiàn)這樣的情況圖二 上述情況很麻煩...
編寫:王采荷 感覺已經(jīng)很久沒有在簡書上分享自己的東西了溅固,今天在集合其他大佬的力量終于把“如何用R語言做差異代謝物的kegg富集分析”這個問題給解...
經(jīng)歷過OrthoMCL軟件包安裝的艱辛(然而募书,終究也沒安裝成功)异雁,就知道轉(zhuǎn)而用BPGA包是有多么香了华临。話不多說窘行,來看看BPGA是如何安裝且使用的...
整理:王采荷 一饥追、下載同一種屬不同species下的微生物16S rDNA 使用NCBI網(wǎng)站:https://www.ncbi.nlm.nih....
整理:dayueban 主要目的是方便日常對測序數(shù)據(jù),如編碼某個蛋白的基因在物種間序列上的相似性比較罐盔。 一但绕、軟件下載和安裝 blast軟件網(wǎng)址:...
編譯:王采荷 關(guān)于進(jìn)化樹(系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,Phylogenetic tree)惶看,一般也叫作系統(tǒng)進(jìn)化樹它的用途我這里就不在贅述了捏顺。因為遠(yuǎn)的不說,就...
導(dǎo)讀 菌群分類數(shù)據(jù)的可視化纬黎,包括豐度在個體之間以以及組間的一個比較怎么生動形象幅骄,一直是我想解決的問題,今天看到一篇文章上面用的是ggplot2包...
由于沒有服務(wù)器本今,只能自己搗鼓著用windows的cmd命令行來批量下載一些數(shù)據(jù)拆座,但是windows下高通量測序數(shù)據(jù)(如sra)下載體驗真的很差,...
編譯:大月半 責(zé)編:王采荷 2020年初诈泼,新型冠狀病毒逐漸開始肆虐全球懂拾,其傳染性和致病力和SARS病毒及MERS病毒相比是有過之而無不及。即便如...