單行命令,化繁為簡鲸郊,重劍無鋒,大巧不工类咧。接下來學(xué)習(xí)生信實用單行命令昌腰。 基礎(chǔ)awk和sed命令 sed: stream editor流編輯器 提取...
![240](https://upload.jianshu.io/collections/images/1666748/crop1537839766355.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
單行命令,化繁為簡鲸郊,重劍無鋒,大巧不工类咧。接下來學(xué)習(xí)生信實用單行命令昌腰。 基礎(chǔ)awk和sed命令 sed: stream editor流編輯器 提取...
概述 在Linux的grep命令中如何使用or奈懒,and奠涌,not操作符呢? 其實磷杏,在grep命令中溜畅,有or和not操作符的等價選項,但是并沒有g(shù)r...
前言 ??對于用Linux來處理數(shù)據(jù)的用戶來說茴丰,應(yīng)該都知道Linux處理數(shù)據(jù)的三個強(qiáng)有力的命令awk达皿、sed、grep——人稱三劍客贿肩。那么今天想...
在NGS基礎(chǔ):測序原始數(shù)據(jù)下載一文中提到可以使用SRA-toolkit中的命令fastq-dump從NCBI下載原始測序數(shù)據(jù)龄寞,命令如下汰规。 這個代...
【生信技能樹】sam和bam格式文件的shell小練習(xí) LINUX練習(xí)題 1) 統(tǒng)計共多少條reads(pair-end reads這里算一條)...
簡單的語句 兩文件的交集和差集 例子 aaa.txt文本 bbb.txt 求aaa.txt和bbb.txt的差集 awk 交集 NR表示已經(jīng)處理...
文章源地址awk命令是Linux系統(tǒng)里非常強(qiáng)大和功能豐富的文本行處理工具命令,使用方法簡單物邑,但是功能豐富溜哮,處理文本的速度也非常快色解。awk是Lin...
snakemake是一個用來編寫任務(wù)流程的工具茂嗓,用python編寫的,因此其執(zhí)行的流程腳本也比較通俗易懂科阎,易于理解述吸。 一、從一個簡單的例子開始 ...
聽老大嗶哩嗶哩視頻中的linux文本處理的部分锣笨,其中講到三駕馬車(grep蝌矛、awk、sed)部分很快就迷糊了错英,工欲善其事入撒,必先利其器。這幾種文本...
Ubuntu18.04.2LTS安裝、配置判哥、美化 安裝準(zhǔn)備 準(zhǔn)備Ubuntu18.04鏡像 關(guān)閉Secure Boot 硬盤分區(qū) 硬盤一般分為I...