GATK官方給出了從RNA-seq數(shù)據(jù)中尋找變異位點(diǎn)的流程花竞，但這個示意圖比較簡潔藻雌，實際操作時一不小心就會報錯，故經(jīng)過探索竹海，記錄下這個流程的細(xì)節(jié)以...
投稿
收錄了4篇文章 · 1人關(guān)注
-
使用GATK從RNA-seq數(shù)據(jù)中call variants -
bwa bowtie2 salmon subread hisat2建索引和比對bwa bowtie salmon 直接從fastq到達(dá)特異性表達(dá)矩陣 subread 備注：需要對應(yīng)建索引的軟件版本，版本不同會報錯叶圃！ his...
-
RNA-seq(1) :用conda安裝RNA-seq所需要的工具
寫在前面: 來自生信技能樹《生信必修課之軟件安裝》學(xué)會用包管理工具安裝軟件 普通安裝和配置席舍，請看這篇Linux下bowtie2安裝(非conda...
-
一個植物轉(zhuǎn)錄組項目的實戰(zhàn)（轉(zhuǎn)載）其實這個植物是擬南芥，所以跟人類研究的數(shù)據(jù)處理大同小異奠蹬。 轉(zhuǎn)錄組 轉(zhuǎn)錄組測序的研究對象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有 RNA 的總...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1837645/crop1574315821187.jpg', '推薦專題《RNA—seq》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.reibang.com/c/acd80cdec328?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}