前言 ??一般生物信息分析流程都包含很多的分析步驟，這些步驟之間的聯(lián)系也有很多情況议薪。例如疙咸，流程的步驟中有不少是依賴上一步的結(jié)果县匠，同時(shí)也有些步驟之...
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WDL： 快速編寫(xiě)屬于你的分析流程 -
如何用wdl編寫(xiě)生信流程
作者：童蒙審稿：同塵編輯：amethyst 引言 生信分析離不開(kāi)各種各樣的流程。一個(gè)好的流程可以幫我們快速的完成各種各樣的分析撒轮。然而乞旦，如何讓我們...
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WDL學(xué)習(xí)筆記
官網(wǎng)是用來(lái)學(xué)習(xí)的最好的地方（然而我也沒(méi)怎么看...）！ WDL是什么题山？ WDL是由Broad Institute開(kāi)發(fā)的一種流程開(kāi)發(fā)語(yǔ)言兰粉，全稱wo...
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利用WDL語(yǔ)言書(shū)寫(xiě)數(shù)據(jù)處理流程The Workflow Description Language (WDL) is a way to specify data process...
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WDL-第5學(xué)
問(wèn)題：用bam2fastx將bam文件轉(zhuǎn)成fastq格式，這里面學(xué)到的知識(shí)： 學(xué)會(huì)寫(xiě)parameter_meta顶瞳，介紹輸入輸出玖姑，它是可以幫忙生成...
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WDL-第4學(xué)
問(wèn)題：用flash批量完成數(shù)據(jù)的拼接，這里面學(xué)到的知識(shí)點(diǎn) 用struct構(gòu)建reads的批量輸入 可選擇參數(shù) 解決辦法： 來(lái)源于bioWDL的一...
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WDL-第3學(xué)
接下來(lái)多個(gè)章節(jié)都是基于 v1.1語(yǔ)法[https://github.com/openwdl/wdl/blob/main/versions/1.1...
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WDL-第2學(xué)本節(jié)主要講述如何配置Cromwell和運(yùn)行一個(gè)簡(jiǎn)單的hello world的WDL腳本慨菱，主要分下面：本節(jié)內(nèi)容來(lái)自Five minute to C...
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WDL-第1講
WDL后續(xù)一系列學(xué)習(xí)筆記均來(lái)自官方文檔[https://cromwell.readthedocs.io/en/stable/CommandLin...
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