寫在前面 時(shí)間撥回去 2015年肛响,那時(shí)我接觸生信已有一年,TBtools 開發(fā)尚在萌芽階段惜索。那會(huì)特笋,我寫了幾款小的軟件,包括 “blast3go”...
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GRO-seq 分析 第一篇就以最近做過的GRO-seq分析為例來展開吧。 GRO-seq的原理和用處 GRO-seq 全稱 Global ru...
師弟:師兄猎物,火山圖怎么得到的虎囚?我都快愁死了......師兄:你不是學(xué)過R語言嗎?師弟:道理倒是都懂蔫磨,看書歸看書淘讥,但是實(shí)際應(yīng)用起來大腦就一片空白,...
前情提要 搞NGS堤如,注釋文件是我們經(jīng)常需要用到的蒲列。但是不同的實(shí)驗(yàn)室偏愛的數(shù)據(jù)庫各不相同,甚至同一個(gè)課題組的小伙伴都會(huì)選擇不同來源的數(shù)據(jù)庫搀罢。那么不...
high-throughput seq analysis急先鋒——STAR的使用介紹 在所有物是人非的景色里蝗岖,我最中意你。 正體 這次給大家?guī)?..
歡迎關(guān)注微信公眾號“生信小王子”榔至! 前幾期抵赢,小編已經(jīng)教大家完成了RNA-seq數(shù)據(jù)的質(zhì)控,下面就要正式開始轉(zhuǎn)錄組分析啦洛退! 通過二代測序我們可以獲...
載入數(shù)據(jù) mycounts<-read.csv("2020武漢加油.csv")head(mycounts)rownames(mycounts)<...
tags: Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對后續(xù)分析至關(guān)重要瓣俯,去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效...
前言 我們知道二代RNA-seq這個(gè)過程中會(huì)經(jīng)過PCR擴(kuò)增,但是PCR具有偏好性,這樣就導(dǎo)致了有點(diǎn)序列擴(kuò)增的多,有的少.在總擴(kuò)增倍數(shù)相同的基礎(chǔ)上...
中游分析這個(gè)詞是我杜撰的,用來強(qiáng)調(diào)表達(dá)矩陣構(gòu)建過程并不簡單兵怯。 0 前言 前幾天Jimmy老師發(fā)了一篇 我用這個(gè)技能一杯咖啡的功夫就掙了800塊錢...