1.首先安裝eggnog-mapper軟件 注釋所需要的物種數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址如下辟癌,同時也可以用里面的腳本download_eggnog_data.py...
![240](https://upload.jianshu.io/collections/images/1931496/genome.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
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什么是KEGG KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系統(tǒng)分析基因功能、基因組信息數(shù)據(jù)庫含滴,...
實驗中經(jīng)常需要從基因組中提取、序列用于設計引物胶果,或者進行基因功能研究等匾嘱,之前看到別人使用的一個腳本,自己拿來用一下早抠,感覺確實很方便 在網(wǎng)站[ht...
seqkit的使用方法[https://bioinf.shenwei.me/seqkit/]seqkit github[https://gith...
?本章將介紹一些極簡單的RNA生信分析,如利用在線網(wǎng)站預測RNA分子二級結(jié)構(gòu)蕊连,分析非編碼RNA(non-coding RNA)等悬垃。前面我們講過D...
27. 序列l(wèi)ogo圖繪制 清除當前環(huán)境中的變量 設置工作目錄 使用seqLogo包繪制序列l(wèi)ogo圖 使用ggseqlogo包繪制序列l(wèi)ogo...
最近看了幾篇關于共線性分析的微信/簡書推送,發(fā)現(xiàn)不少研究人員把“編碼基因共線性”錯誤地描述為“全基因組共線性”甘苍。這是兩個完全不同的概念尝蠕,前者主要...
導讀 從網(wǎng)上收集的一些數(shù)據(jù)庫信息,方便學習查看: VFDB PHI TCDB Swiss Prot Pfam GO eggnog-mapper:...
“進化樹的構(gòu)建怎么操作载庭?”“那肯定是用MEGA翱幢恕!” 可是真的好麻煩啊昧捷,要先比對再建樹闲昭,然后再進行各種美化罐寨,習慣了R就用R解決吧靡挥。 簡單Goog...
MCScanX一般是做基因組之間的共線性 一、MCScanX安裝 MCScanX官網(wǎng)http://chibba.pgml.uga.edu/mcs...