發(fā)簡信
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R（tidyverse包）常用操作
提取列 對列進(jìn)行選擇 select 函數(shù) 提取行 對行進(jìn)行選擇 filter 函數(shù)slice（）：按位置提取行filter（）：提取符合特定邏輯...
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Docker 基本操作
重要操作 常見命令 高級命令 不進(jìn)入容器使用工具
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根據(jù)基因名稱批量提取基因序列實驗中經(jīng)常需要從基因組中提取台颠、序列用于設(shè)計引物枯怖，或者進(jìn)行基因功能研究等，之前看到別人使用的一個腳本萍桌，自己拿來用一下宵溅，感覺確實很方便 在網(wǎng)站[ht...
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uniport ID 轉(zhuǎn)換為 gene symbol（ID轉(zhuǎn)換）網(wǎng)站 ID轉(zhuǎn)換網(wǎng)址[https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php] input 選擇 unipr...
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samtools 序列比對率計算（samtools flagstat）準(zhǔn)備序列比對后生成的 bam 文件或者 .sam 文件 結(jié)果解釋從第一行至第十一行分別表示： QC pass的reads的數(shù)量為2499971，...
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bedtools 批量提取snp前后1000bp片段
準(zhǔn)備條件1 知曉snp位置上炎，位于第 x 條染色體上 12345678 bp2 生成 .txt 文件恃逻，文件格式如下 第一列表示 snp 染色體位...
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SSR (misa + primer3 ) 設(shè)計SSR引物
先下載 primer3 和 misa 相關(guān)文件 misa 相關(guān)文件放在百度云鏈接：https://pan.baidu.com/s/1C4eU30...
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R_柱狀圖（加誤差線，顯著性差異）先放最終效果圖
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雜種指數(shù)（HI,hybridindex）計算
HI = 100×（Hi - Mi1）/（Mi2-Mi1）Hi ：雜交種平均值Mi1：母本平均值Mi2：父本平均值 HI 介于45-55之間屬...