轉(zhuǎn)載GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（下） 原創(chuàng)：礦工堿基礦工2018-03-23 前言 在上一篇文章中我已經(jīng)用例子仔細(xì)跟大家分享了WGS從...

基因流（也稱基因遷移）是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)描孟，從而改變?nèi)后w“基因庫(kù)”的組成刁卜。通過基因交流向群體中引入新的等位基因，...

劉小澤寫于19.1.20-21要進(jìn)行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每個(gè)基因?qū)?yīng)什么樣的GO/KEGG分類惊暴，OrgDb就是存儲(chǔ)不同數(shù)據(jù)庫(kù)基因...

====環(huán)境和測(cè)試數(shù)據(jù)準(zhǔn)備===== 需要先安裝OrthoFinder穷劈，這個(gè)參考前面一個(gè)帖子。然后今天我們主要來測(cè)試CAFE冤荆。 安裝也比較簡(jiǎn)單：...

親緣關(guān)系分析實(shí)操 前期準(zhǔn)備 給標(biāo)記加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈現(xiàn)，拿到VCF文件的第一件事情就是添加各個(gè)SNP位點(diǎn)的ID...

利用協(xié)方差矩陣外邓，特征值和特征向量將高緯變量投影到數(shù)個(gè)低維變量的過程撤蚊； PCA分析的過程就是從千萬級(jí)別的SNP位點(diǎn)中提取關(guān)鍵信息，以便使用更少的變...