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46篇文章 · 27663字 · 2人關注

推薦 | VCF2PCACluster快速實現(xiàn)超大規(guī)模SNP的PCA分析
推薦一個高效做PCA分析的工具蚕礼，從VCF文件到直接出圖的一鍵式分析楣黍，對于小白非常友好。小明哥剛開發(fā)時小編就在用了管闷，那時還叫MingPCAClus...

0.7 577 0 1
pip安裝PyVCF后有問題：ImportError: cannot import name 'Reader' from 'parser'
問題 Python通過pip安裝PyVCF成功拯刁，但運行腳本時出現(xiàn)問題：解決使用conda重新安裝： Ref：https://github.c...

3.0 233 0 1

關于Jupyter notebook無法自動跳轉瀏覽器
這個問題網上已經有一堆回答了，如：解決Jupyter-notebook不自動跳轉瀏覽器的詳細方法[https://zhuanlan.zhihu...

3.3 4323 0 2
Centos安裝Singularity記錄
環(huán)境依賴 golang安裝 Singularity安裝直接在默認路徑上編譯會報錯何鸡，顯示Go沒有找到纺弊，可是明明能運行go：刪除整個singul...

3.5 994 0 4
解決tabix建索引報錯[E::hts_idx_push] Unsorted positions on sequence #
當我對兩個基因型文件位置取交集，并重新生成兩個vcf：出現(xiàn)如下錯誤：原因是位點未排序骡男。因此可知bcftools從vcf取位點子集時淆游，并不會對...

0.7 1585 0 1
Xshell5+Xftp5永久安裝與使用（不自動更新）
Xshell是我用過最好的終端訪問服務器的軟件，搭配Xftp文件傳輸隔盛，體驗很好犹菱。不過6及以后版本就收費了，雖然對于學校和家庭使用可以免費吮炕，但每次...

0.7 4302 0 1
Admixture只能用整數(shù)染色體: "Invalid chromosome code. Use integers!"
原始帖 Admixture做群體結構分析是好用腊脱，但也有一些不順手的地方。最大的問題是不支持非整數(shù)的染色體號龙亲！相信我們手里絕大部分vcf或pli...

3.5 1516 0 2

vscode 通過ssh遠程連接多臺服務器陕凹？
需求想要把在linux終端操作的習慣改到本機上來。理由如下： linux下的vim對于編程調試不是很方便鳄炉；編程與命令不能很好鏈接杜耙，經常要多開...

6.3 4639 0 20
使用transanno制作不同基因組版本坐標映射的chain 文件？
不同基因組版本的位置（坐標）對應關系拂盯，在數(shù)據(jù)分析環(huán)節(jié)經常用到佑女。位置對應關系通常通過比對來獲取，而信息一般存儲在chain文件中[https:/...

5.2 1999 5 4