6p21.31這種表示方式在人類遺傳學(xué)中用得比較多看彼。在參考基因組出來之前哆窿，人們通過做實(shí)驗(yàn)染色的方法將染色體染成很多段（就是那種很經(jīng)典的黑白灰分段...

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1. Gencode 官網(wǎng)：https://www.gencodegenes.org/ 1.1 The GENCODE Project: Enc...

上一篇寫的是：重復(fù)一篇文獻(xiàn)的GWAS（一）：基因型數(shù)據(jù)整理這一篇主要講GWAS的核心流程和畫圖憎茂。 軟件使用參考：使用GEMMA進(jìn)行復(fù)雜性狀全基因...

文獻(xiàn)：A new regulator of seed size control in Arabidopsis identified by a g...

上個(gè)月中旬珍语，出于對GWAS的好奇，我參加了一個(gè)培訓(xùn)班竖幔，之后又花了一周的時(shí)間來整理聽課筆記板乙，感覺現(xiàn)在對GWAS已經(jīng)有了一個(gè)比較全面的認(rèn)識(shí)。 在ca...

比如 個(gè)體分型率 < 90% 某一個(gè)樣本測出來的標(biāo)記小于全部標(biāo)記的90% 標(biāo)記分型率 < 90% 某一個(gè)標(biāo)記只在小于90%的樣本中存在 最小等位...

在學(xué)習(xí)基因型填充之前需要了解一下什么是Phasing（基因定相拳氢、單倍體分型）募逞，主要是參考公眾號堿基礦工中的一篇文章：人類基因組的Phasing原...

1.下機(jī)數(shù)據(jù)質(zhì)量控制 主要是針對低質(zhì)量的reads和含有adapter的reads，我事先并不知道adapter序列馋评，所以就只過濾了低質(zhì)量的re...