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【最新匯總】單細胞轉錄組分析與繪圖系列
分析 單細胞分析實錄(1): 認識Cell Hashing[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkzMzE5NT...
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答讀者問(8)：如何批量查詢marker基因(對應的蛋白)會不會在膜上表達恩敌？做實驗的朋友們對這個問題應該是很感興趣的僧凰，因為涉及到后續(xù)能不能實驗驗證羡儿。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文獻败匹，查網(wǎng)站撮胧。我知道的：unipro...
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【單細胞高級繪圖】11.marker展示_分組氣泡圖忙里偷閑桨踪，整理了一套繪圖代碼，代碼300行芹啥，效果如上圖所示：其實就是把單細胞轉錄組中常見的氣泡圖根據(jù)分組信息展開了锻离，代碼目前適用于分組后leve...
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如何獲取kegg通路的基因列表
如何獲取kegg通路的基因列表？相信很多人都有這個疑惑墓怀。 哪些時候需要知道通路的基因列表汽纠？舉兩個例子： 在找差異基因這一步，只想針對特定通路的基...
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一個對接CellPhoneDB的R包首先祝大家新年快樂傀履！新的一年paper多多虱朵，順順利利！ cpplot:Visualize the results of cell-cell co...
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CellPhoneDB三個版本（V2、V3卧秘、V4）之間的對比
上個月在小組會上做了一期細胞互作的分享呢袱，目前剪了一部分出來。后續(xù)還有cellchat翅敌、nichenet以及演示的部分羞福，等剪輯好了再發(fā)。 視頻介紹...
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10套代碼讓你學會單細胞高級繪圖
4000+人次獲取代碼 高級繪圖這個系列已經(jīng)出了10期了蚯涮，最開始的出發(fā)點是想把用過的不錯的代碼整理出來治专，方便自己也幫助大家。從第1篇300+小伙...
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【單細胞高級繪圖】10.KEGG富集結果的圓圈圖本次教程的figure仍然是讀者求助的圖遭顶，算得上是kegg富集圖的新流派张峰。據(jù)我的調查，該圖應該是基迪奧云-平-臺首創(chuàng)(https://www.o...
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【單細胞高級繪圖】09.細胞通訊_兩組比較_連線圖上周一位讀者聯(lián)系我棒旗，讓我?guī)兔Πl(fā)一個繪圖的單子喘批。在朋友圈發(fā)單后，感興趣的朋友很多铣揉，有十幾位還私聊我讓我分享一下代碼饶深，可見大家還是很感興趣的。不過等...