
寫在前面 手上小朋友課題做的基因結構注釋矯正娄蔼,為此也喊他練練手瘸羡,做一些有用的東西出來峦树,今天介紹其中一個掩宜。目前,有不少朋友開始重視基因結構注釋質量...
寫在前面 前述確定下來參與 CGMonline 首次線下年會青灼,原本以為是去做個報告,后面提了做個技術培訓十绑,最后定下來是只做會前的技術培訓聚至。本次報...
寫在前面 前述,為了開展基因組相關課題脆诉,獲取準確的基因結構注釋信息甚亭,我舍棄了 IGV-GSAme贷币,因為他的實現不夠優(yōu)雅】髡基于多次嘗試多次失敗的基...
寫在前面 前兩日役纹,在廣西-南寧場生信暑期研討會(2023年07月)結束后,有兩位小朋友分別針對 GSAman 提了建議(2023年08月暇唾,廣州場...
這段時間策州,不時有朋友提到瘸味,GSAman 比 IGV 官方版本慢不少。事實上够挂,這個幾乎不可能旁仿。因為 GSAman 本身并無改動 IGV 完整源碼。...
很多做基因組方面研究的朋友办悟,都經常會關注一個事情尘奏,大體就是「完美參考基因組」,這個完美基因組病蛉,或者是比如青銅級炫加,黃金級,鉆石級铡恕,gap-free...
常見的電子注釋錯誤問題挺多琢感,比如UTR長度不對,缺少外顯子內含子探熔,邊界有問題驹针。沒注釋出來等等。這些就不做記錄诀艰。此處主要記錄一些有趣的問題 轉錄本...
雖然,我在 IGV 的基礎上其垄,優(yōu)化增強苛蒲,并開發(fā)了 IGV-GSAman,但其實我也就前幾天才認認真真自己用了下绿满,也做了不少優(yōu)化臂外。大體上,應該是花...
不少朋友提了一些關于 GSAman 的建議,其中部分我們有采納漏健,主要原因是我自己其實基本沒用 GSAman 實戰(zhàn)過嚎货。這個與 TBtools 不同...