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使用jcvi繪制微共線性(Microsynteny)這篇文章更多是記錄性質(zhì)的，因?yàn)闆](méi)有詳細(xì)說(shuō)明如何從WGDI, MCScan, MCscanX中獲取基因?qū)η蚧耍矝](méi)介紹如何整理出記錄基因坐標(biāo)的bed文...
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使用jcvi基于wgdi的共線性結(jié)果(-icl)繪制點(diǎn)圖
在如何用WGDI進(jìn)行共線性分析(上)[http://www.reibang.com/p/a50548e81ac0], 我們基于blastp的結(jié)...
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如何安裝JCVI
使用conda安裝 使用時(shí)需要啟動(dòng)環(huán)境 在此基礎(chǔ)上可以更新到最新版的JCVI (Github版本會(huì)不斷的增加新功能并修訂bug） 安裝額外的依賴...
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「JCVI教程」如何繪制CNS級(jí)別的共線性圖（上）本教程借鑒https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version). 我們...
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「JCVI教程」JCVI的模塊簡(jiǎn)介JCVI的使用基本格式為python -m jcvi.模塊.子功能 實(shí)際操作，因此了解JCVI的模塊能夠幫助我們?nèi)フ业叫枰墓δ堋８鶕?jù)JCVI的...
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「JCVI教程」如何在Linux下安裝JCVI
JCVI是利用Python編寫的，能用于基因組組裝窃这、注釋和比較基因組學(xué)分析。之前寫過(guò)幾篇介紹它的使用征候，這篇單獨(dú)介紹它的安裝杭攻。此外，雖然JCVI最...
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「JCVI教程」如何繪制CNS級(jí)別的共線性圖（中）在「JCVI教程」編碼序列或蛋白序列運(yùn)行共線性分析流程（上）還是有一個(gè)尷尬的事情倍奢，就是只用到兩個(gè)物種朴上，不能展示出JCVI畫圖的方便之處垒棋，因此這里...
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「JCVI教程」如何基于物種的CDS的blast結(jié)果繪制點(diǎn)圖(dotplot)這是唐海寶老師GitHub上的JCVI工具的非官方說(shuō)明書卒煞。該工具集的功能非常多，但是教程資料目前看起來(lái)并不多叼架，因此為了能讓更多人用上那么好用的工...
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jcvi.apps里的fetch模塊使用介紹
這是唐海寶老師GitHub上的JCVI工具的非官方說(shuō)明書畔裕。該工具集的功能非常多，但是教程資料目前看起來(lái)并不多乖订，因此為了能讓更多人用上那么好用的工...
