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答讀者問(8)：如何批量查詢marker基因(對(duì)應(yīng)的蛋白)會(huì)不會(huì)在膜上表達(dá)？做實(shí)驗(yàn)的朋友們對(duì)這個(gè)問題應(yīng)該是很感興趣的，因?yàn)樯婕暗胶罄m(xù)能不能實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證桐玻。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文獻(xiàn)，查網(wǎng)站。我知道的：unipro...
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【單細(xì)胞高級(jí)繪圖】11.marker展示_分組氣泡圖忙里偷閑薪者，整理了一套繪圖代碼，代碼300行剿涮，效果如上圖所示：其實(shí)就是把單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組中常見的氣泡圖根據(jù)分組信息展開了言津，代碼目前適用于分組后leve...
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如何獲取kegg通路的基因列表
如何獲取kegg通路的基因列表？相信很多人都有這個(gè)疑惑取试。 哪些時(shí)候需要知道通路的基因列表悬槽？舉兩個(gè)例子： 在找差異基因這一步，只想針對(duì)特定通路的基...
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一個(gè)對(duì)接CellPhoneDB的R包首先祝大家新年快樂瞬浓！新的一年paper多多初婆，順順利利！ cpplot:Visualize the results of cell-cell co...
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CellPhoneDB三個(gè)版本（V2、V3磅叛、V4）之間的對(duì)比
上個(gè)月在小組會(huì)上做了一期細(xì)胞互作的分享屑咳，目前剪了一部分出來。后續(xù)還有cellchat弊琴、nichenet以及演示的部分兆龙，等剪輯好了再發(fā)。 視頻介紹...
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10套代碼讓你學(xué)會(huì)單細(xì)胞高級(jí)繪圖
4000+人次獲取代碼 高級(jí)繪圖這個(gè)系列已經(jīng)出了10期了敲董，最開始的出發(fā)點(diǎn)是想把用過的不錯(cuò)的代碼整理出來紫皇，方便自己也幫助大家。從第1篇300+小伙...
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【單細(xì)胞高級(jí)繪圖】10.KEGG富集結(jié)果的圓圈圖本次教程的figure仍然是讀者求助的圖腋寨，算得上是kegg富集圖的新流派聪铺。據(jù)我的調(diào)查，該圖應(yīng)該是基迪奧云-平-臺(tái)首創(chuàng)(https://www.o...
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【單細(xì)胞高級(jí)繪圖】09.細(xì)胞通訊_兩組比較_連線圖上周一位讀者聯(lián)系我萄窜，讓我?guī)兔Πl(fā)一個(gè)繪圖的單子铃剔。在朋友圈發(fā)單后，感興趣的朋友很多脂倦，有十幾位還私聊我讓我分享一下代碼番宁，可見大家還是很感興趣的。不過等...
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【單細(xì)胞高級(jí)繪圖】08.細(xì)胞通訊_兩組比較_氣泡圖細(xì)胞通訊分析赖阻，我很早之前就寫過蝶押，當(dāng)時(shí)詳細(xì)介紹了CellPhoneDB的原理、實(shí)操火欧、可視化棋电。單細(xì)胞分析實(shí)錄(18): 基于CellPhoneDB的...
