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【代謝設(shè)計(jì)】RetroPathRL逆合成軟件代謝工程的目標(biāo)是從活的生物體中產(chǎn)生令人感興趣的化學(xué)物質(zhì)，從而向更綠色的化學(xué)方向發(fā)展贡这。盡管付出了努力，但研究和開發(fā)過程仍然漫長而昂貴，而且需要高效...
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【數(shù)據(jù)庫】RxnFinder
由胡春楠老師團(tuán)隊(duì)開發(fā)的生物合成反應(yīng)數(shù)據(jù)庫（RxnFinder）睡陪，這個(gè)數(shù)據(jù)庫由專門的公司團(tuán)隊(duì)在維護(hù)更新。下面是官網(wǎng)介紹： 微生物細(xì)胞工廠在生產(chǎn)大宗...
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【數(shù)據(jù)庫】RetroRulesRetroRules是一個(gè)代謝途徑發(fā)現(xiàn)和代謝工程的反應(yīng)規(guī)則數(shù)據(jù)庫。反應(yīng)規(guī)則是對(duì)反合成工作流程中所使用的反應(yīng)的一般描述兰迫，以便枚舉連接目標(biāo)分子與前體...
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#代謝通路分析工具#
opencobra 開源的基于約束的生物重建信殊、分析和建模的工具（分別在MatLab、python汁果、Julia）涡拘。COBRA方法廣泛應(yīng)用于prok...
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#代謝通路設(shè)計(jì)# 第一期學(xué)習(xí)小組分享會(huì)-代謝數(shù)據(jù)庫的介紹和使用
第一期學(xué)習(xí)小組分享會(huì)，主題為代謝數(shù)據(jù)庫的介紹和使用据德，主要內(nèi)容為KEGG鳄乏、BIGG、MetaCyc晋控、MetaRxn汞窗、BRENADA、SEED赡译、AT...
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【學(xué)習(xí)筆記】基因組水平的代謝模型今天我又復(fù)習(xí)了之前看的《Metabolic Pathway Design:A Practical Guide》的第一章仲吏，運(yùn)行了書中python包...
