上一篇筆記里練習了如何使用WDL+Cromwell來打印hello world羞秤。這篇筆記就來練習一下運行GATK的haplotypeCaller...

視頻地址：這里，這是Broad Institute團隊GATK系列視頻的最后一講左敌，主要是給學生演示如何使用WDL運行任務瘾蛋。WDL的教程，GATK...

這篇筆記是幾個視頻內(nèi)容的綜合矫限，每個視頻里我只選取了幾張PPT哺哼。主講人舉例了一篇已經(jīng)發(fā)表的文章來進行具體的流程分析。這篇文章里的外顯子數(shù)據(jù)分析基本...

這一視頻講的是somatic variants discovery叼风，主要是集中在腫瘤樣品上取董。視頻地址：here 下面這幅圖簡單的展示了在腫瘤環(huán)境...

這篇筆記是這個系列視頻的第5講，筆記有的是用英文記的无宿，有的用中文甲葬。因為是用零碎的時間來看視頻記筆記，所以用英語還是中文看當時的心情懈贺。。坡垫。 視頻地...

視頻地址：https://www.youtube.com/watch?v=dgzkXLfFAf8&list=PLjiXAZO27elDHGlQw...

無意間發(fā)現(xiàn)了油管上有一個系列視頻梭灿，是Broad Institute在去年發(fā)布的課程，這個課程主要是對GATK第4版進行的一個系統(tǒng)的介紹冰悠。所以我也...

這篇筆記是對GATK官網(wǎng)上發(fā)布的尋找突變體之前的數(shù)據(jù)預處理這一塊內(nèi)容的學習筆記堡妒。實際上也是一篇翻譯筆記。原文在這里溉卓，是發(fā)表在20多天前的皮迟，是一個...