15篇文章 · 8305字 · 5人關(guān)注
-
Q：非腫瘤>>IC/BPS間質(zhì)性膀胱炎？無(wú)意中看到一篇關(guān)于IC/BPS的非腫瘤文章，還有臨床驗(yàn)證，非常值得模仿。 Title: Bruton tyrosine kinase (BTK)...
-
TCGA|一致性聚類(lèi)一致性聚類(lèi)基于重采樣方法驗(yàn)證聚類(lèi)的合理性，非常適合分子分型文章呻征。下面就學(xué)起來(lái)。數(shù)據(jù)下載參考：R|TCGA|m6AlncRNA[https://w...
-
TCGA差異分析|2.DESeq2DESeq2真狠罢浇，TCGA-PRAD數(shù)據(jù)差異分析用了半個(gè)小時(shí)陆赋，而且還是多線程。這速度也沒(méi)啥提升呀 聲明：本文僅供學(xué)習(xí)交流用嚷闭，禁止用于商業(yè)用途攒岛，如...
-
TCGA差異分析|1.非參數(shù)檢驗(yàn)
無(wú)意中翻到生信大神果子老師和洲更老師神仙大家的帖子，樣本足夠多時(shí)非參數(shù)檢驗(yàn)就夠用了（DESeq2可以先等等）胞锰。wx搜索：《學(xué)好統(tǒng)計(jì)灾锯，我10分鐘就...
-
R| Agilent芯片分析-limmaAglient的芯片在科研界也是一大寵兒，通常根據(jù)其染色分為單通道和多通道兩種嗅榕。最為奇葩的是Aglient芯片的許多表達(dá)矩陣下載后發(fā)現(xiàn)有空值顺饮、負(fù)...
-
R|illumina芯片beads系列-lumiIllumina是常見(jiàn)的3大制造商之一，lumi包主要針對(duì)Illumina公司出品的bead系列表達(dá)譜和甲基化芯片進(jìn)行質(zhì)控凌那、標(biāo)準(zhǔn)化兼雄，獲得表達(dá)矩陣...
-
R|邊距參數(shù)cheatsheet日常R語(yǔ)言學(xué)習(xí)搬運(yùn)工，在可視化過(guò)程中帽蝶，經(jīng)常需要設(shè)置圖片的空白間隔赦肋，這個(gè)時(shí)候經(jīng)常是臨時(shí)抱佛腳，剛好在網(wǎng)上看到一份很好的How big is you...
-
R|FPKM、RPKM差異分析
芯片數(shù)據(jù)差異分析金砍，常規(guī)用limma進(jìn)行差異分析局蚀，而對(duì)于RNA-seq數(shù)據(jù)，常用edgeR恕稠、DEseq2和limma包數(shù)據(jù)分析，但數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)必須是c...
-
R|Affymetrix芯片分析(2)-oligo對(duì)于更新版的Affymetrix芯片扶欣，如Affymetrix Human Gene 1.1 ST Array鹅巍，affy就顯得無(wú)能為力了。這時(shí)候o...