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群落微生物物種豐度表-繪制堆疊柱形圖(ggplot 2) 今天我們先來講一下如何利用細(xì)菌群落的高通量測序數(shù)據(jù)來繪制堆疊柱形圖來展示不同樣品中優(yōu)勢...
T檢驗(yàn) 在做微生物群落分析時經(jīng)常要尋找不同群落之間的差異,我們會經(jīng)常關(guān)心兩個或者多個群落之間是否顯著不同力崇。就兩個微生物群落間的比較斗塘,T檢驗(yàn)是最常...
pheatmap包來顯示行或列的分組信息 行或列的分組注釋信息 在EXCEL中整理好樣本和物種的注釋信息,當(dāng)然這個需要依據(jù)你的具體需求來確定亮靴。 ...
運(yùn)用 R語言 pheatmap 包繪制熱圖(基礎(chǔ)部分) 注意內(nèi)容: 對繪圖文件格式的說明 對數(shù)據(jù)處理的說明馍盟,這里的數(shù)據(jù)是物種屬水平相對豐度表 對...