基因敲除技術(shù)簡(jiǎn)介
CRISPR/Cas(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/ Cas)系統(tǒng)是目前被廣泛運(yùn)用的基因編輯系統(tǒng),其原理是由CRISPR轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的gRNA介導(dǎo)Cas核酸酶靶向目標(biāo)序列斤斧,對(duì)序列進(jìn)行切割。其中最常用的是靶向DNA的CRISPR/Cas9系統(tǒng)熬词,此系統(tǒng)是由II類CRISPR/Cas系統(tǒng)改造而來,能夠在植物讥脐、細(xì)菌因悲、酵母、魚類及哺乳動(dòng)物等多種細(xì)胞中罪帖,進(jìn)行有效的靶向編輯,具有操作簡(jiǎn)易邮屁、效率高整袁、以及作用靶位點(diǎn)多等優(yōu)勢(shì)。
CRISPR/Cas9系統(tǒng)中sgRNA(short guide RNA)識(shí)別并結(jié)合目標(biāo)基因的靶向序列佑吝,引導(dǎo)Cas9對(duì)結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行剪切坐昙,產(chǎn)生DNA雙鏈斷裂(double-strand break, DSB),機(jī)體自身通過非同源重組(non-homologous end joining芋忿,NHEJ)的方式修復(fù)DSB炸客,參與修復(fù)的蛋白經(jīng)常會(huì)在DNA末端插入或刪除幾個(gè)堿基,修復(fù)后的基因由于產(chǎn)生突變而導(dǎo)致功能喪失戈钢,從而實(shí)現(xiàn)機(jī)體內(nèi)的基因敲除嚷量。
技術(shù)原理與流程
基因敲除技術(shù)優(yōu)勢(shì)
Cas9X使用新的實(shí)驗(yàn)?zāi)P蛯⒓?xì)胞系的敲除效率進(jìn)行大幅的提升
1. 使用Cas9蛋白和gRNA的復(fù)合物直接進(jìn)行電轉(zhuǎn),提高效率的同時(shí)減少非特異的切割逆趣;(目前報(bào)道脫靶率最低的方法)
2. 使用高效的電轉(zhuǎn)設(shè)備,具備更高的電轉(zhuǎn)效率和細(xì)胞存活率嗜历;
3. 使用更先進(jìn)的單克隆稀釋設(shè)備和方法宣渗,大幅提高陽性率抖所;(提高2倍)
4. 持續(xù)建庫:我們也將提供更多的標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞株和基因編輯細(xì)胞株產(chǎn)品供科研工作者選擇。
5. 大片段敲除痕囱,可以通過PCR快速鑒定田轧;
6. 非移碼方式敲除,可以保證細(xì)胞系做基因回補(bǔ)無需考慮突變修飾的問題鞍恢。??
通過優(yōu)化傻粘,Cas9X在細(xì)胞系基因敲除的效率是傳統(tǒng)質(zhì)粒法的數(shù)倍(3-5倍)結(jié)合ClonePlus技術(shù),可以將效率提升10-15倍帮掉,也可以針對(duì)很多之前難以實(shí)現(xiàn)敲除的細(xì)胞株進(jìn)行基因敲除操作弦悉,而且周期比病毒法更短。最快可以5周內(nèi)拿到基因敲除的細(xì)胞蟆炊!
基因敲除技術(shù)的應(yīng)用及前景
1.?建立生物模型稽莉。在基因功能,代謝途徑等研究中模型生物的建立非常重要涩搓∥鄹眩基因敲除技術(shù)就常常用于建立某種特定基因缺失的生物模型,從而進(jìn)行相關(guān)的研究昧甘。這些模型可以是細(xì)胞良拼,也可以是完整的動(dòng)植物或微生物個(gè)體。最常見的是小鼠充边,家兔庸推、豬、線蟲痛黎、酵母和擬南芥等的基因敲除模型也常見于報(bào)道予弧。
2. 疾病的分子機(jī)理研究和疾病的基因治療。通過基因敲除技術(shù)可以確定特定基因的性質(zhì)以及研究它對(duì)機(jī)體的影響湖饱。這無論是對(duì)了解疾病的根源或者是尋找基因治療的靶目標(biāo)都有重大的意義掖蛤。
3.?提供廉價(jià)的異種移植器官。眾所周知井厌,器官來源稀少往往是人體器官移植的一大制約因素蚓庭,而大量廉價(jià)的異種生物如豬等的器官卻不能用于人體。這是因?yàn)楫愒瓷锏幕驎?huì)產(chǎn)生一些能引起人體強(qiáng)烈免疫排斥的異源分子仅仆,如果能將產(chǎn)生這些異源分子的基因敲除器赞,那么動(dòng)物的器官將能用于人體的疾病治療,這將為患者帶來具大的福音墓拜。如:PPL Therapeutics 公司于1999 年已成功地在豬的體細(xì)胞中用基因敲除技術(shù)敲除了α-1港柜,3GT 基因。使每只豬都缺乏產(chǎn)生a1-3半乳糖基轉(zhuǎn)移酶的基因的2個(gè)拷貝。這些酶在細(xì)胞表面產(chǎn)生一種糖分子夏醉,人體的免疫系統(tǒng)可以立即辨認(rèn)出這種糖分子為異源性爽锥,從而引發(fā)超急性免疫排斥反應(yīng)。在缺乏這種酶的情況下畔柔,超急性排斥反應(yīng)即不會(huì)再發(fā)生氯夷。
4.?免疫學(xué)中的應(yīng)用。同異源器官移植相似靶擦,異源的抗體用于人體時(shí)或多或少會(huì)有一定的免疫排斥腮考,使得人用抗體類藥物的生產(chǎn)和應(yīng)用受阻。而如果將動(dòng)物免疫分子基因敲除玄捕,換以人的相應(yīng)基因踩蔚,那么將產(chǎn)生人的抗體,從而解決人源抗體的生產(chǎn)問題桩盲。
5.?改造生物寂纪、培育新的生物品種。細(xì)菌的基因工程技術(shù)是本世紀(jì)分子生物學(xué)史上的一個(gè)重大突破赌结,而基因敲除技術(shù)則可能是遺傳工程中的另一重大飛躍捞蛋。它為定向改造生物,培育新型生物提供了重要的技術(shù)支持柬姚。
發(fā)表的高分文獻(xiàn)
1. Cas9X?基因編輯服務(wù):影響因子為38.12
Ma B, Ju A, Zhang S, et al. Albumosomes formed by cytoplasmic pre-folding albumin maintain mitochondrial homeostasis and inhibit nonalcoholic fatty liver disease[J]. Signal Transduction and Targeted Therapy, 2023, 8(1): 229.
2. Cas9X?基因編輯服務(wù):影響因子為23.65
Wu W, Pu Y, Gao S, et al. Bacterial Metabolism-Initiated Nanocatalytic Tumor Immunotherapy[J]. Nano-Micro Letters, 2022, 14(1): 1-21.
3.Cas9X?基因編輯服務(wù):影響因子為17.694
Bu, J., Zhang, Y., Wu, S. et al. KK-LC-1 as a therapeutic target to eliminate ALDH+ stem cells in triple negative breast cancer. Nat Commun 14, 2602 (2023).
4. Cas9X?基因編輯服務(wù):影響因子為8.322
Li W, Ali T, Zheng C, et al. Fluoxetine regulates eEF2 activity (phosphorylation) via HDAC1 inhibitory mechanism in an LPS-induced mouse model of depression[J]. Journal of neuroinflammation, 2021, 18(1): 1-19.
5. Cas9X?基因編輯服務(wù):影響因子為15.992
Li W, Ali T, Zheng C, et al. Anti-depressive-like behaviors of APN KO mice involve Trkb/BDNF signaling related neuroinflammatory changes[J]. Molecular Psychiatry, 2022, 27(2): 1047-1058.
6. Cas9X?基因編輯服務(wù):影響因子為5.59
Xiao P, Chen J, Zeng Q, et al. UNC5B Overexpression Alleviates Peripheral Neuropathic Pain by Stimulating Netrin-1-Dependent Autophagic Flux in Schwann Cells[J]. Molecular Neurobiology, 2022: 1-15.