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畢業(yè)論文
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附錄A 本研究納入研究的數(shù)據(jù)下載與整理
- 基因芯片數(shù)據(jù)下載 久锥、整理
- TCGA 數(shù)據(jù)的下載 、整理
- GTEx 數(shù)據(jù)下載异剥、整理
- ICGC 數(shù)據(jù)下載瑟由、整理
- CCLE 數(shù)據(jù)下載、整理
- GTF 注釋文件下載冤寿、整理
- 批次效應(yīng)矯正
- PCA
- 基因注釋
- Venn Diagram
附錄B 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)
附錄C 差異表達(dá)分析
- 基因芯片的差異表達(dá)分析
- 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-Seq)數(shù)據(jù)的差異表達(dá)分析:DESeq2歹苦、edgeR、limma
附錄D 多組學(xué)分析
- 基因突變分析
- DNA甲基化分析
- 免疫浸潤(rùn)分析
附錄E 機(jī)器學(xué)習(xí)構(gòu)建模型
- 預(yù)測(cè)模型構(gòu)建:支持向量機(jī)督怜、隨機(jī)森林殴瘦、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)........
- 預(yù)測(cè)模型驗(yàn)證