本文來(lái)源于微信公眾號(hào)：生信狂人虐杯，SCI狂人團(tuán)隊(duì)已經(jīng)獲取原文作者授權(quán)玛歌，更多資料可以關(guān)注微信公眾號(hào)：生信狂人
總有人說(shuō)想要純生信套路，今天它來(lái)了擎椰。分享一篇最新的純生信單基因獨(dú)立預(yù)后發(fā)文思路的文章支子，這篇文章發(fā)表在journal of cancer(影響因子：3.565)，發(fā)表時(shí)間于2020年10月17日达舒。
研究背景：
核糖核苷二磷酸還原酶亞基M2（RRM2）是核糖核苷酸還原酶的催化亞基值朋，可調(diào)節(jié)酶活性，這對(duì)于DNA復(fù)制和修復(fù)至關(guān)重要巩搏。然而昨登，RRM2在肺腺癌（LUAD）中的作用仍不清楚。
研究方法：
在這項(xiàng)研究中贯底，我們探討了TCGA丰辣，GEO，Oncomine禽捆，UALCAN笙什，PrognoScan和 Kaplan-Meier Plotter在LUAD中RRM2的表達(dá)模式和預(yù)后價(jià)值，并通過(guò)Cox分析證實(shí)了其獨(dú)立的預(yù)后價(jià)值胚想。LinkedOmics和GEPIA2用于研究與RRM2相關(guān)的共表達(dá)和功能網(wǎng)絡(luò)琐凭。此外，我們使用TIMER來(lái)評(píng)估RRM2與主要六種腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞之間的相關(guān)性浊服。最后淘正，通過(guò)TIMER門(mén)戶(hù)通過(guò)腫瘤純度校正的部分Spearman秩相關(guān)系數(shù)摆马，檢查了免疫調(diào)節(jié)劑，趨化因子和28種腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞（TIL）和RRM2的免疫特征之間的相關(guān)性鸿吆。
研究結(jié)果：
在TCGA-LUAD的腫瘤組織中發(fā)現(xiàn)RRM2上調(diào)囤采，并在多個(gè)獨(dú)立隊(duì)列中進(jìn)行了驗(yàn)證。此外惩淳，無(wú)論是在TCGA還是其他隊(duì)列中蕉毯，均發(fā)現(xiàn)高RRM2表達(dá)與不良的生存率相關(guān)。Cox分析表明思犁，高RRM2表達(dá)是LUAD總體生存代虾，疾病特異性生存和無(wú)進(jìn)展生存的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。功能網(wǎng)絡(luò)分析表明激蹲，RRM2通過(guò)涉及多種與癌癥相關(guān)的激酶和E2F家族的途徑來(lái)調(diào)節(jié)真核生物中的RNA轉(zhuǎn)運(yùn)棉磨，卵母細(xì)胞減數(shù)分裂，剪接體学辱，核糖體生物發(fā)生以及細(xì)胞衰老信號(hào)傳導(dǎo)乘瓤。同樣，RRM2表達(dá)與B細(xì)胞策泣，CD4 + T細(xì)胞和嗜中性粒細(xì)胞的浸潤(rùn)水平相關(guān)衙傀。隨后的分析發(fā)現(xiàn)，B細(xì)胞和樹(shù)突狀細(xì)胞可以預(yù)測(cè)LUAD的預(yù)后萨咕。通過(guò)Cox分析將B細(xì)胞確定為六種類(lèi)型免疫細(xì)胞中的獨(dú)立危險(xiǎn)因素统抬。最后，相關(guān)分析表明RRM2與我們進(jìn)行的免疫標(biāo)記的67.68％（624/922）相關(guān)危队。
研究結(jié)論：
我們的研究表明聪建，RRM2可以獨(dú)立預(yù)測(cè)LUAD的預(yù)后，并與免疫浸潤(rùn)有關(guān)茫陆。特別是金麸，RRM2和B細(xì)胞標(biāo)記基因之間的緊密關(guān)系是免疫反應(yīng)的潛在中心，也是影響預(yù)后的關(guān)鍵因素之一盅弛。我們的發(fā)現(xiàn)為進(jìn)一步研究RRM2在LUAD中的免疫調(diào)節(jié)作用奠定了基礎(chǔ)。
分析內(nèi)容如下：
1叔锐、對(duì)RRM2做差異分析挪鹏，并在多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行驗(yàn)證
2、RRM2表達(dá)與臨床特征的相關(guān)性分析
3愉烙、生存分析
4讨盒、單因素、多因素Cox 回歸分析
5步责、RRM2共表達(dá)分析返顺、GO禀苦、KEGG分析
6、RRM2與免疫細(xì)胞的相關(guān)性分析
