2021-07-04 CRISPR-Cas9 基因編輯原理詳解

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12169 人閱讀 發(fā)布時(shí)間:2019-07-16 16:46

CRISPR-Cas 系統(tǒng)(The clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats-associated protein systems)是一個(gè)細(xì)菌及古細(xì)菌進(jìn)化出來(lái)用以抵御病毒和質(zhì)粒入侵的適應(yīng)性機(jī)制贝或。CRISPR-Cas 系統(tǒng)的高效基因組編輯功能已被應(yīng)用于多種生物余掖,包括斑馬魚蝎毡、小鼠、大鼠撕贞、秀麗隱桿線蟲(chóng)螃壤、植物及細(xì)菌赐劣。多個(gè)科研小組的研究都顯示映九,與鋅指核酸酶(ZFNs)和轉(zhuǎn)錄激活樣效應(yīng)核酸酶(Transcription activator-like effector nucleases, TALEN)相比較,CRISPR-Cas 系統(tǒng)介導(dǎo)的基因組靶向?qū)嶒?yàn)在細(xì)胞或斑馬魚中具有相似甚至更高的效率沃暗。

CRISPR-Cas9 體系的 RNA-DNA 識(shí)別機(jī)制為基因組工程研究提供了一項(xiàng)簡(jiǎn)便而強(qiáng)大的工具月洛。該體系其中一個(gè)最重要的優(yōu)勢(shì)是 Cas9 蛋白可在多個(gè)不同的 gRNA 的引導(dǎo)下同時(shí)靶向多個(gè)基因組位點(diǎn)。

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圖 1. CRISPR/Cas9 介導(dǎo)的基因組編輯原理圖

在 II 型 CRISPR 系統(tǒng)中孽锥,CRISPR RNA(crRNA)與轉(zhuǎn)錄激活 crRNA(Trans-activating crRNA, tracrRNA)退火形成的復(fù)合物能特異識(shí)別基因組序列嚼黔,引導(dǎo) Cas9 核酸內(nèi)切酶在目的片段生成 DNA 雙鏈斷裂(double-strand breaks, DSBs)细层。 這個(gè)識(shí)別復(fù)合體可以通過(guò)融合 crRNA 與 tracrRNA 序列形成 sgRNA(single-guided RNA)進(jìn)行簡(jiǎn)化』=В基因組的靶序列中有長(zhǎng)約 20bp 的片段與 crRNA 或 sgRNA 互補(bǔ)配對(duì)今艺;靶序列末端的三核苷酸區(qū)域 PAM(5『-NGG-3』)為 Cas9 識(shí)別位點(diǎn),是實(shí)現(xiàn)剪切功能的關(guān)鍵爵卒。

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圖 2. CRISPR-Cas9 介導(dǎo)的基因編輯虚缎。(左):sgRNA 引導(dǎo) Cas9 核酸酶作用于基因組,形成的 DSBs 被非同源末端連接(NHEJ)機(jī)制修復(fù)钓株;(右):sgRNA 引導(dǎo) Cas9 核酸酶作用于基因組实牡,形成 DSBs,同源重組(HR)作用下轴合,供體質(zhì)粒上的目標(biāo)基因及篩選標(biāo)記(或其他遺傳元件)在斷裂處被整合進(jìn)基因組创坞。

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圖 3: 切口酶在結(jié)合鏈生產(chǎn)單鏈切口的原理圖

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| 基因敲除 | <u style="box-sizing: border-box;">sgRNA文庫(kù)</u> |
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| 預(yù)制穩(wěn)轉(zhuǎn)株 | <u style="box-sizing: border-box;">GeneHero? CRISPRi 預(yù)制穩(wěn)轉(zhuǎn)株</u> |
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| 功能驗(yàn)證 | <u style="box-sizing: border-box;">IndelCheck? CRISPR/TALEN 插入缺失檢測(cè)體系</u> |

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