公眾號-科研私家菜學習記錄(5)

交叉驗證與模型選擇

  • 定義:亦稱循環(huán)估計晋南,是一種統(tǒng)計學上將數(shù)據(jù)樣本切割成較小子集的實用方法◎纪眨可以先在一個子集上做建模分析魄幕,而其它子集則用來做后續(xù)對此分析的效果評價及驗證。一開始的子集被稱為訓練集(Train set)颖杏。而其它的子集則被稱為驗證集(Validation set)或測試集(Test set)纯陨。
  • 交叉驗證是一種評估統(tǒng)計分析、機器學習算法對獨立于訓練數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)集的泛化能力(Generalize)输玷。交叉驗證大致分為三種:簡單交叉驗證(hold-outcross validation)队丝、k-折交叉驗證(k-fold cross validation)和留一交叉驗證(leave one out cross validation)。
  • R包實現(xiàn):ISLR
  1. 示例
library(ISLR)
data('Auto') ##載入數(shù)據(jù)集
head(Auto)
set.seed(111)

n=nrow(Auto) ## 共392個樣本
train=sample(n,n/2) ## 選擇50%的樣本作為訓練集
test=(-train) ## 50%的樣本作為測試集


lm.fit=lm(mpg~horsepower, data=Auto, subset=train) 
## 使用訓練集擬合線性回歸模型
## 以horsepower來擬合mpg的值
mean((Auto[test,'mpg']-predict(lm.fit, newdata=Auto[test,]))^2) ## 計算均方誤差

lm.fit2=lm(mpg~poly(horsepower,2), data=Auto, subset=train) 
## 使用訓練集擬合多項式回歸
mean((Auto[test,'mpg']-predict(lm.fit2, newdata=Auto[test,]))^2) ## 均方誤差

簡單交叉驗證

MSE=matrix(NA,10,10) ## 建10行10列的Matrix

for(seed in 1:10){
  set.seed(seed)
  train=sample(n,n/2)
  test=(-train)
  for(degree in 1:10){
    lm.fit=lm(mpg~poly(horsepower,degree), data=Auto,subset=train)
    MSE[seed,degree]=mean((Auto[test,'mpg']-predict(lm.fit,newdata=Auto[test,]))^2)  
  }
}
## 結(jié)果可視化
plot(MSE[1,],
     ylim=range(MSE),
     type='l',
     lwd=2,
     col=rainbow(10)[1],
     xlab='degree',
     ylab='the estimated test MSE')

for(seed in 2:10){
  points(MSE[seed,],
         type='l',
         lwd=2,
         col=ggsci::pal_npg()(10)[seed])
} 

K-折交叉驗證

library(boot)
cv.error.10=rep(NA,10)
for(degree in 1:10){
  glm.fit=glm(mpg ~ poly(horsepower,degree), data=Auto)
  set.seed(1234)
  cv.error.10[degree] <- cv.glm(Auto,glm.fit,K=10)$delta[1]
}
cv.error.10

plot(cv.error.10,type='b',xlab='degree',col=ggsci::pal_npg()(10))

留一交叉驗證

loocv.error=rep(NA,10)
for(degree in 1:10){
  glm.fit=glm(mpg ~ poly(horsepower,degree), data=Auto)
  loocv.error[degree]=cv.glm(Auto,glm.fit,K = nrow(Auto))$delta[1]
}
loocv.error 

plot(loocv.error,type='b',xlab='degree',col=ggsci::pal_npg()(10))
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