TIFF 圖像實(shí)操

在《TIFF 圖像格式介紹》文章簡(jiǎn)要介紹了 TIFF 圖像結(jié)構(gòu),本文用代碼實(shí)操一下。
演示圖片下載自:https://camelyon17.grand-challenge.org/Data/

演示圖片

用 QuPath 打開圖片载矿,在左邊屬性可看到這個(gè) H&E 圖片是金字塔結(jié)構(gòu)的,存儲(chǔ)了不同分辨率的圖像。
用 Python 也可以看到有多個(gè) pages 每個(gè) page 對(duì)應(yīng)一個(gè)圖像婆芦。

>>> import tifffile
>>> wsi = tifffile.TiffFile("test_001.tif")
>>> wsi
<tifffile.TiffFile 'test_001.tif'>
>>> pages = wsi.pages
>>> len(pages)
9

第一個(gè) page 對(duì)應(yīng)分辨率最高的圖像,它是 tile 存儲(chǔ)形式喂饥,可以查看到 tile 長(zhǎng)寬都是 512.

>>> page0 = pages[0]
>>> page0.tilelength
512
>>> page0.tilewidth
512

使用 .tags 獲取到圖像 metadata 也即 IFD entry. 比如下面我們可以查看 tile 存儲(chǔ)位置(offset)消约,假如自己寫讀取代碼,那么可以根據(jù)位置讀取到 tile 數(shù)據(jù)员帮。

>>> page0_tags = page0.tags
>>> page0_tags["ImageWidth"].value
86016
>>> page0_tags["ImageLength"].value
89600
>>> page0_tags["TileOffsets"].value[0:5]
(16, 3586416, 3596929, 7268478, 7279382)

比較一下不同分辨率圖像大小或粮。

>>> page1 = pages[1]
>>> print(page0.imagelength, page0.imagewidth)
89600 86016
>>> print(page1.imagelength, page1.imagewidth)
44800 43008
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市捞高,隨后出現(xiàn)的幾起案子氯材,更是在濱河造成了極大的恐慌,老刑警劉巖棠枉,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,126評(píng)論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件浓体,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異,居然都是意外死亡辈讶,警方通過查閱死者的電腦和手機(jī)命浴,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,254評(píng)論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來,“玉大人生闲,你說我怎么就攤上這事媳溺。” “怎么了碍讯?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 152,445評(píng)論 0 341
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵悬蔽,是天一觀的道長(zhǎng)。 經(jīng)常有香客問我捉兴,道長(zhǎng)蝎困,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 55,185評(píng)論 1 278
  • 正文 為了忘掉前任倍啥,我火速辦了婚禮禾乘,結(jié)果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘虽缕。我一直安慰自己始藕,他們只是感情好,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,178評(píng)論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開白布氮趋。 她就那樣靜靜地躺著伍派,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪剩胁。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上诉植,一...
    開封第一講書人閱讀 48,970評(píng)論 1 284
  • 那天,我揣著相機(jī)與錄音昵观,去河邊找鬼倍踪。 笑死,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛索昂,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播扩借,決...
    沈念sama閱讀 38,276評(píng)論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼椒惨,長(zhǎng)吁一口氣:“原來是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼!你這毒婦竟也來了潮罪?” 一聲冷哼從身側(cè)響起康谆,我...
    開封第一講書人閱讀 36,927評(píng)論 0 259
  • 序言:老撾萬榮一對(duì)情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎嫉到,沒想到半個(gè)月后沃暗,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,400評(píng)論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡何恶,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 35,883評(píng)論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年孽锥,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 37,997評(píng)論 1 333
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡惜辑,死狀恐怖唬涧,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情盛撑,我是刑警寧澤碎节,帶...
    沈念sama閱讀 33,646評(píng)論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站抵卫,受9級(jí)特大地震影響狮荔,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜介粘,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,213評(píng)論 3 307
  • 文/蒙蒙 一殖氏、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧碗短,春花似錦受葛、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 30,204評(píng)論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至巡雨,卻和暖如春闰渔,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背铐望。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 31,423評(píng)論 1 260
  • 我被黑心中介騙來泰國打工冈涧, 沒想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人正蛙。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,423評(píng)論 2 352
  • 正文 我出身青樓督弓,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像,于是被迫代替她去往敵國和親乒验。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子愚隧,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,722評(píng)論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容