昨天是學(xué)會(huì)裝系統(tǒng)——Linux桨吊，那今天就相當(dāng)于下載一個(gè)軟件商店——Miniconda喜庞，并且學(xué)習(xí)了如何安裝軟件株搔。
如何下載Miniconda
1.用uname -a代碼查看服務(wù)器是幾位的
2.百度搜索miniconda 清華筑辨，找到對應(yīng)版本，復(fù)制鏈接（key word：latest 纲堵，Linux巡雨，sh）https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/ 3.輸入wget 鼠標(biāo)右鍵點(diǎn)擊，粘貼復(fù)制的網(wǎng)址
如何安裝Miniconda
1.bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh席函，這里在下圖手動(dòng)輸sh铐望，然后回車，就開始安裝了茂附。正蛙。中間會(huì)出現(xiàn)很多的版權(quán)信息，按回車跳過它們营曼，在需要輸yes的地方手動(dòng)yes一下乒验，圖二顯示的就是安裝完成。
3.命令行繼續(xù)輸入conda蒂阱，顯示一大串信息锻全，說明成功。
4.添加鏡像蒜危，把下面的代碼全部復(fù)制到命令行虱痕，粘貼、回車辐赞。
使用清華鏡像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
如何使用conda
1.查看服務(wù)器上安裝的所有軟件列表 conda list
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安裝軟件 conda install fastqc -y 【-y是yes，安裝過程中conda問你的問題全部回答yes】如果想要具體到版本號响委，可以（conda install fastqc=0.11.7 -y）
4.卸載軟件 conda remove fastqc -y
conda環(huán)境
1.查看當(dāng)前環(huán)境——conda info --envs
2.創(chuàng)建環(huán)境（假設(shè)要?jiǎng)?chuàng)建一個(gè)用來rna-seq的conda環(huán)境） conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
創(chuàng)建完之后可以用命令conda info --envs查看一下新思，帶是默認(rèn)，這里base還是默認(rèn)
3.激活環(huán)境 conda activate rna-seq赘风，這時(shí)默認(rèn)的就會(huì)轉(zhuǎn)移到rna-seq前夹囚，并且在用戶名root前面出現(xiàn)了(rna-seq)，這時(shí)在輸入fastqc邀窃，如果出現(xiàn)大片信息提示荸哟，說明就可以正常使用了
4.退出當(dāng)前環(huán)境，conda deactivate （操作在上圖）
