Perron M, DeBlois J, Desponts M (2013) Use of resampling to assess optimal subgroup composition for estimating genetic parameters from progeny trials. Tree Genet Genomes 9:129–143. doi: 10.1007/s11295-012-0540-5
摘要
在文獻中廣泛報道了基于樣本數(shù)量減少的木材性狀遺傳參數(shù)估計拜银，但很少有調(diào)查考慮了這些小群體對參數(shù)估計精度的影響匣椰。這項研究的目的是通過改變每個家庭的家庭數(shù)量或個人數(shù)量（樹木）以及通過驗證某些遺傳參數(shù)的準確性（跨試驗分析）來確定子群抽樣的最佳策略阴孟。為了實現(xiàn)這一點番电，使用無替換（k01,000 /對變化因子）對包含兩個針葉樹種（Larix laricina和Picea mariana）的10年總高度的數(shù)據(jù)集進行模擬撒强，以及木材密度的pilodyn測量對26歲的馬來西亞人進行了評估挽荡。 SAS倦零？9.2宏語言和程序用于估計具有不同減少采樣的幾個遺傳參數(shù)的置信區(qū)間误续。模擬結(jié)果表明，減少每個家庭每個家庭的樹木數(shù)量對遺傳參數(shù)估計的數(shù)量和精度的影響比減少家庭數(shù)量扫茅，特別是對于高度和木材密度的半同胞遺傳力和B型遺傳相關(guān)性的影響更大蹋嵌。在評估木材性狀，樹種育種研究或規(guī)劃森林樹種的青少年追溯后代試驗時诞帐，優(yōu)先評估遺傳參數(shù)準確性的最佳二次抽樣策略應(yīng)成為常見的做法欣尼。
關(guān)鍵詞Bootstrap置信區(qū)間。森林樹。遺傳參數(shù)的準確性愕鼓。模擬钙态。木材特征。高度
介紹
在全球范圍內(nèi)菇晃，許多樹木改良計劃處于第二或第三繁殖周期（例如册倒，White等人2007）。在第一代磺送，主要選擇標準是增長驻子，軀干直線度和適應(yīng)性，主要是基于經(jīng)濟重要性估灿，易于測量和后代試驗的年齡崇呵。然而，如許多最近的研究（Blackburn et al馅袁。2010; Gapare et al域慷。2010; Lenz et al。2010; P鈗ues et al汗销。2010; Stackpole et al犹褒。2010）所述，木材性狀在許多樹中越來越受到關(guān)注改進計劃弛针。預(yù)計未來選擇對木材性狀的越來越多的直接選擇（例如叠骑，Perron 2008; Apiolaza 2009）。
估計森林樹木性狀的遺傳參數(shù)通诚髯拢基于半同胞或全同族家庭的類內(nèi)相關(guān)性（參見Cornelius 1994審查）宙枷。確切地說，這種估計方法至少需要100個基因（Lynch和Walsh 1998; White et al付材。2007）朦拖。近幾十年來，對木性狀的定量遺傳學進行了許多研究厌衔。傳統(tǒng)的方法是減少采樣璧帝，因為評估木材性狀大群體表型所需的成本和時間。****已經(jīng)使用許多不同的抽樣策略來減少人口數(shù)量：家庭的隨機亞群（例如富寿，Greaves等人睬隶，1996; Bouffier等人，2008; El-Kassaby等人页徐，2011）苏潜，基于先前測量的分層亞群（例如，Wang等人1999; Kumar等人2006; Ukrainetz等人2008; Blackburn等人变勇，2010）恤左，每個家庭使用較少的個體（樹）（例如Zhang等人2004; Krakowski等人2005; Stackpole等等贴唇，2010），因為破壞性分析或與稀疏操作相關(guān)聯(lián)飞袋，最后使用較少的塊（Fries和Ericsson 2006; Li等人2007; Gapare等人戳气，2010）。
據(jù)我們所知巧鸭，盡管許多研究已經(jīng)減少了采樣來估計森林樹木后代試驗中木材性狀的遺傳參數(shù)瓶您，但只有Li et al。 （2007）已經(jīng)檢查了抽樣子群的質(zhì)量纲仍。這與對現(xiàn)場和交配設(shè)計的影響的大量調(diào)查（例如呀袱，Namkoong和Roberds 1974; Cotterill和James 1984; Huber等人1992; Isik等人2005; Gezan等人2006）和空間自相關(guān)（例如，Wright 1978; Magnussen 1993; Fu等人1999; Dutkowski等2006）對森林樹木估計遺傳參數(shù)的準確性郑叠。
因此夜赵，本研究的目的是（1）通過改變每戶家庭和樹木的數(shù)量來確定估計遺傳參數(shù)所需的亞組的最佳尺寸和組成，（2）將不同的二次抽樣策略與全部人口估計值進行比較锻拘，最后油吭，（3）調(diào)查從各種亞組獲得的估計遺傳參數(shù)的準確性。為了實現(xiàn)這些目標署拟，我們在兩個針葉樹種的后代試驗中模擬了無替換（RRWR）的隨機重采樣，其中包含全群10年總高度測量值歌豺。對木材性狀進行了額外的模擬推穷，使用了在大型二次采樣樹上含有pilodyn木材密度測量的數(shù)據(jù)集。
