新格元Celescope（三）：multi_rna生成單細(xì)胞基因表達(dá)矩陣

修改mapfile文件

SRR14711566 /work/home/acwnw4bl7y/SRR14711566   Ferulic

修改run_shell.sh腳本文件

multi_rna\
 --mapfile ./rna1.mapfile \
 --genomeDir /work/home/acwnw4bl7y/Rat \
 --thread 64 \
 --mod shell \
 --outdir ./20240930 \
 --chemistry scopeV1

運(yùn)行

sh /work/home/acwnw4bl7y/celescope_test_script/rna/2run_shell.sh

或者

cd /work/home/acwnw4bl7y/celescope_test_script/rna/
sh 2run_shell.sh

提交計(jì)算任務(wù)

source ~/miniconda3/bin/activate
conda activate celescope
sh /work/home/acwnw4bl7y/celescope_test_script/rna/shell/Ferulic.sh

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