空間組學(xué)(Spatial Omics)技術(shù)在2022年被《Nature》雜志列為最值得關(guān)注的七大技術(shù)之一脚线,被譽(yù)為“生命科學(xué)”的下一個風(fēng)口宣蠕。之前小編剛介紹了市場上較成熟的空間組學(xué)產(chǎn)品例隆,其中包括10x Genomics的Visium平臺。近期摩根大通(JP Morgan)會議上抢蚀,10x Genomics又發(fā)布了升級版本Visium HD镀层。
10x Genomics公司首席執(zhí)行官Serge Saxonov在本周于摩根大通(JP Morgan)舉行的醫(yī)療保健會議上重點(diǎn)介紹了公司的產(chǎn)品開發(fā)路線圖,并詳細(xì)介紹了公司產(chǎn)品組合即將取得的進(jìn)展。在發(fā)言的最后唱逢,他宣布推出新的Visium HD系統(tǒng)吴侦,將現(xiàn)有Visium平臺的分辨率從55微米光斑提高到2x2微米正方形,從而實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞水平的分析坞古。新系統(tǒng)現(xiàn)已開始接受訂購备韧,旨在滿足客戶對更高分辨率Visium產(chǎn)品的需求。
10x Genomics宣布他們已經(jīng)出貨了500臺Visium CytAssist儀器痪枫,這為除了Xenium之外的Visium HD奠定了基礎(chǔ)织堂。
現(xiàn)有的10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組捕獲區(qū)域6.5x6.5mm易阳、spot數(shù)量約5000個、spot直徑 55μm吃粒、分辨率100μm潦俺、支持HE染色。而新發(fā)布的Visium HD平臺將直徑 55μm直徑的圓形區(qū)域改成了2x2μm的正方形徐勃,數(shù)目也從5千個spot大幅提升到1100萬個squares黑竞,并且正方形之間沒有缺少探針的真空地帶,實(shí)現(xiàn)了NO GAPs疏旨。
從圖中我們可以直觀的看到升級后的Visium HD的數(shù)據(jù),不再是一個個圓點(diǎn)組成的區(qū)域檐涝,而是更為密集且充滿整個組織區(qū)域的表達(dá)圖譜遏匆,這將解決10x Genomics平臺一直被詬病的分辨率不足的問題,真正可以達(dá)到單個細(xì)胞的分辨率谁榜。
Visium HD將在24年一季度發(fā)貨,對于已經(jīng)擁有CytAssist的人來說窃植,他們只需要預(yù)訂芯片和相關(guān)套件進(jìn)行升級帝蒿。
10x Genomics也展示了他們總體的產(chǎn)品策略:繼續(xù)用更高的分辨率和更高的通量來淘汰舊的遺留技術(shù)巷怜。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組(Chromium平臺)現(xiàn)在可以實(shí)現(xiàn)每個細(xì)胞數(shù)千個轉(zhuǎn)錄本的捕獲測序葛超,這是下一代測序技術(shù)(Next-generation sequencing)在細(xì)胞分辨率上的更進(jìn)一步。另一個是原位技術(shù)(Xenium平臺)可以在高分辨率下完成大型圖像繪制延塑。
現(xiàn)在10x Genomics的第三個支柱是Visium HD,它實(shí)現(xiàn)了在空間轉(zhuǎn)錄組水平的第三條產(chǎn)品線关带。10x Genomics強(qiáng)調(diào)產(chǎn)品的互補(bǔ)性侥涵,輔以軟件集成,它允許研究人員在所有3個平臺上無縫地觀察給定樣本的可比數(shù)據(jù)點(diǎn)。