發(fā)簡信
IP屬地：山西
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腳本更新----細胞的空間臨近性分析
作者祷舀，Evil Genius 希望我也無奈去搞盜版的時候，大家能理解~~~庇楞，辛苦創(chuàng)作是真的不如搞盜版，而且搞盜版的我發(fā)現(xiàn)在碩士博士取视，醫(yī)學(xué)生群體口...
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腳本更新----空間鄰域差異分析（高精度平臺甥材，Xenium、CosMx谢床、CODEX兄一、圖像分割Stereo-seq、HD）作者识腿，Evil Genius 今天的目標(biāo)出革，實現(xiàn)如下的分析 對于空間轉(zhuǎn)錄組而言，高精度平臺圖像分割獲取單細胞精度的矩陣絕對是必做的渡讼。大家如果選擇做...
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腳本更新----空間轉(zhuǎn)錄組信號流COMMOT與空間inferCNV（封裝版）作者骂束，Evil Genius 針對visium、bin模式的Stereo-seq成箫、HD等的腳本更新展箱。 對于單細胞而言，大家網(wǎng)上找點代碼分析出個結(jié)...
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課程補充----單細胞空間聯(lián)合分析之RCTD封裝版（針對visium蹬昌、bin模式的Stereo-seq析藕、HD）作者，Evil Genius 關(guān)于RCTD凳厢，本來都不打算更新了账胧，R版本的聯(lián)合分析我覺得大家自己寫寫就完了，現(xiàn)在看來先紫，還是需要整理一下治泥。 文章在R...
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流程更新----空間細胞聚類及配受體共現(xiàn)分析（針對visium、bin模式的Stereo-seq遮精、以及HD）作者居夹，Evil Genius 今天我們分享一個簡答的內(nèi)容，空間細胞聚類與配受體共現(xiàn)本冲。 今年的空間課程給了大家一個方法准脂，當(dāng)然了，都可以用檬洞，也都有...
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頂刊方法補充---腫瘤演化與微環(huán)境相互作用作者狸膏，Evil Genius 周末了，我們復(fù)習(xí)一下添怔，高分文章的方法補充湾戳，文章在 (1)WES數(shù)據(jù)分析,如下 1贤旷、BWA-mem比對（GRCh38...
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流程升級---通過生態(tài)位差異分析確定細胞狀態(tài)轉(zhuǎn)變的外在驅(qū)動因素作者，Evil Genius 今年不知道大家過的怎么樣砾脑？掙到錢了么幼驶？文章發(fā)表了沒？光陰似箭韧衣，大家珍惜讀書的大好時光盅藻。 我們今天的分析從空間轉(zhuǎn)錄組...
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流程更新----10XHD的tiff圖片結(jié)合cellpose進行細胞分割分析獲取單細胞級別的空間表達矩陣作者，Evil Genius 不止一次的說過畅铭，做HD氏淑、Stereo-seq，盡量不要再用bin分割模式顶瞒，采用圖像識別的圖像分割模式夸政，獲取單細胞級...
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流程升級---空間鄰域聚類分析與分層分析（高精度平臺元旬，Stereo-seq榴徐、HD、Xenium匀归、CosMx）作者坑资，Evil Genius 我們今天要實現(xiàn)的目標(biāo)是，依據(jù)細胞鄰域的不同進行細胞類型的分層聚類穆端。 我們在分析高精度平臺的時候袱贮，通過基礎(chǔ)分析，會拿...