清明節(jié)了拂酣，放假期間好好放松一下自己，但是我仍然記得大學(xué)老師說(shuō)過(guò)的一句話仲义，放假休息的同時(shí)婶熬，總結(jié)過(guò)去，展望以后光坝，所以說(shuō)假期是一個(gè)承前啟后的時(shí)間段尸诽，今天我們不講新的東西，而是回顧一下單細(xì)胞軌跡分析的一些內(nèi)容盯另。
第一部分性含，降維，
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第一頁(yè)其實(shí)在說(shuō)明為什么我們數(shù)據(jù)分析的時(shí)候?yàn)槭裁聪纫肞CA降維鸳惯，PCA降維到50-100維
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這一頁(yè)講了tSNE降維的原理和PCA的連用商蕴。那么第一個(gè)問(wèn)題就來(lái)了，為什么我們要先PCA降維后再使用tSNE降維呢芝发？看了PPT相信大家都有答案了吧
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第三頁(yè)關(guān)于UMAP降維绪商，現(xiàn)在明白為什么UMAP降維后的結(jié)果cluster之間的距離為什么變得遠(yuǎn)了吧。
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第四頁(yè)辅鲸，PHATE降維格郁，優(yōu)劣勢(shì)一目了然。
第二部分，軌跡分析
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我們常見(jiàn)的軌跡類型例书。
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分析的一般過(guò)程
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發(fā)育基因的選擇及優(yōu)缺點(diǎn)
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可視化的方法锣尉，知道都是什么軟件做出來(lái)的么？决采？自沧？
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分化推斷知多少
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推斷軟件哪家強(qiáng)？树瞭？拇厢？
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強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)手結(jié)果優(yōu)
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空間軌跡如何斷？晒喷？孝偎？
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方法總比困難多
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總結(jié)也是一種進(jìn)步
生活很好，有你更好
