結(jié)直腸多組學(xué)文章解析 -20200909

?????最近想必大家在公眾號(hào)上看到一則消息盹沈,幾乎刷屏。2020年9月3日,由中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)曾嶸研究組请契、吳家睿研究組與海軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院(上海長(zhǎng)海醫(yī)院)張衛(wèi)研究組聯(lián)合國(guó)科大杭州高等研究院系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室等在Cancer Cell上發(fā)表了題為Integrated Omics of Metastatic?Colorectal Cancer的研究論文。?

看到這個(gè)文章夏醉,小編著實(shí)羨慕了一番爽锥,大樣本量,多組學(xué)研究畔柔,是組學(xué)高水平文章的趨勢(shì)氯夷。同時(shí)大樣本量,多組學(xué)是數(shù)據(jù)挖掘愛(ài)好者必然分析的數(shù)據(jù)來(lái)源靶擦。

????小編一直從事各種組學(xué)的實(shí)驗(yàn)和分析腮考,本期跟大家一起學(xué)習(xí)一下這篇文章擎淤,我們很少有機(jī)會(huì)去自己準(zhǔn)備大量樣本做多組學(xué)實(shí)驗(yàn),但我們每個(gè)做相關(guān)領(lǐng)域研究的秸仙,都可以去分析數(shù)據(jù)嘴拢。在做分子機(jī)制研究挑選分子時(shí),通常要找差異表達(dá)的基因寂纪,蛋白席吴。而這樣的大樣本正是最佳的數(shù)據(jù)。TCGA和GEO基本只有RNAseq相關(guān)的捞蛋,缺乏蛋白表達(dá)譜和磷酸化表達(dá)譜孝冒。

主要討論內(nèi)容:

(1)結(jié)合文獻(xiàn)學(xué)習(xí)多組學(xué)聯(lián)合分析的思路。

(2)作者是如何尋找轉(zhuǎn)移病人獨(dú)有特征的拟杉?

(3)大樣本量的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)如何在自己的文章中使用庄涡?


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