公眾號(hào):生信診斷所
WES數(shù)據(jù)量估算公式:測(cè)序深度 X 目標(biāo)捕獲區(qū)域長(zhǎng)度(exon)/ 捕獲效率
舉例:假如要測(cè)100X呛占,外顯子長(zhǎng)度為30M,某測(cè)序公司的捕獲效率為50%
外顯子探針應(yīng)該就是:外顯子長(zhǎng)度30M x 2(人是二倍體)
那么就 = 100 X 30M X 2 / 50% = 12G
同理:想測(cè)300x數(shù)據(jù)就需要36G數(shù)據(jù)量懦趋,
對(duì)應(yīng)到reads數(shù)就是:假設(shè)測(cè)序類(lèi)型為:PE150晾虑,除以300 = 40M = 4x107reads數(shù)
一般測(cè)序公司返回的數(shù)據(jù)都是測(cè)了多少reads數(shù)。