R 更換Package安裝源

有時候利用R安裝R包,出現(xiàn)錯誤:


Warning in install.packages :

? unable to access index for repository https://cran.rstudio.com/src/contrib:

? cannot open URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/PACKAGES'

Warning in install.packages :

? package ‘readxl’ is not available (for R version 3.4.1)


可能是因為國外的rstudio或者其他源鏈接不上鱼填,此時換成國內(nèi)源即可解決問題宗收,更換方法如下:

##1. 使用Rstudio

打開

tool -> Global options -> packages

##2. 使用終端

在使用終端命令行安裝包的時候喳挑,可以直接指定源,命令如下:

install.packages(‘gdata’, repos = ‘https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN’)

##3. 更改配置文件

linux或mac系統(tǒng)下叹放,安裝速度過慢渴杆,更改為國內(nèi)源方案,編輯~/.Rprofile, 指定國內(nèi)CRAN源:

options(repos=structure(c(CRAN=“https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/”)))

指定國內(nèi)bioconductor源:

source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”)

options(BioC_mirror=“http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/”)

biocLite(“clusterProfiler”)

通過Rprofile自定義函數(shù):

source.bioconductor <- function(){

? ? ? ? ? ? source("http://bioconductor.org/biocLite.R")

? ? ? ? ? ? options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

}

通過調(diào)用source.bioconductor()函數(shù)盖奈,改變源并安裝包

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作者:常玉俊bioinfo

來源:CSDN

原文:https://blog.csdn.net/chang349276/article/details/79295821

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