比對軟件比如bowtie并不支持比對fasta格式的文件谬泌,所以需要把fasta轉(zhuǎn)為fastq格式亲桦,但是fasta和fastq相比缺少質(zhì)量值忆嗜,所以只能偽造一個(gè)加上去凄贩,這里用到seqtk來偽造,從而把fasta格式轉(zhuǎn)fastq格式硕并。
seqtk seq test.fa -F "J" > test.fq
OK了
比對軟件比如bowtie并不支持比對fasta格式的文件谬泌,所以需要把fasta轉(zhuǎn)為fastq格式亲桦,但是fasta和fastq相比缺少質(zhì)量值忆嗜,所以只能偽造一個(gè)加上去凄贩,這里用到seqtk來偽造,從而把fasta格式轉(zhuǎn)fastq格式硕并。
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OK了