書接上回,之前我們在《meta分析的基本步驟是什么怕享?附實例講解执赡,7步快速見刊策略》文章里詳細(xì)給大家介紹了撰寫一篇Meta分析需要經(jīng)過哪些步驟。
今天我們就從這些步驟入手函筋,給大家盤點盤點寫一篇Meta分析具體需要用到哪些meta分析軟件沙合?
一、選題和檢索
選題和檢索基本不需要涉及到什么Meta分析軟件跌帐,通過一些數(shù)據(jù)庫即可完成首懈。
常用的英文文獻(xiàn)檢索平臺有:Pubmed、Embase谨敛、Cochrane Library猜拾、web of science、ClinicalTrials.gov等等佣盒。
中文文獻(xiàn)檢索平臺有:知網(wǎng)挎袜、萬方、SinoMed肥惭、VIP等等盯仪。
二、文獻(xiàn)篩選
文獻(xiàn)篩選這個環(huán)節(jié)主要用到的Meta分析軟件就是我們?nèi)粘J褂玫奈墨I(xiàn)管理軟件蜜葱,Endnote全景、NoteExpress、Zotero等等之類的牵囤。
文獻(xiàn)篩選爸黄,顧名思義就是要從我們檢索到的所有文獻(xiàn)中滞伟,按照預(yù)先制定好的納入排除標(biāo)準(zhǔn)篩選出符合我們要求的納入文獻(xiàn)。
所以這個篩選過程炕贵,其實說簡單點就是利用文獻(xiàn)管理軟件的分組管理功能梆奈,將所有檢索到的文獻(xiàn)按照納排標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行分類,最終按照每一個分組中的文獻(xiàn)數(shù)量繪制文獻(xiàn)篩選流程圖就可以了称开。
分組管理功能是每個文獻(xiàn)管理軟件的基礎(chǔ)功能亩钟,無論你選擇哪款軟件,都沒有什么太大的影響鳖轰,更重要的是要有一個規(guī)范化的篩選思路和流程清酥。
這里我以Endnote文獻(xiàn)管理軟件為例,導(dǎo)入檢索好的所有文獻(xiàn)之后蕴侣,可以使用軟件自帶的篩選重復(fù)文獻(xiàn):
然后利用批量檢索功能焰轻,快速刪除case report和綜述之類的文獻(xiàn):
在閱讀過程中,會發(fā)現(xiàn)一些不相關(guān)的文獻(xiàn)昆雀,也可以利用批量檢索的方法辱志,快速定位到這些文獻(xiàn),然后刪除忆肾。當(dāng)然荸频,這里不是指真的要將文獻(xiàn)放到回收站菱肖,而是要根據(jù)每一次刪除的操作客冈,新建一個分組,將對應(yīng)的文獻(xiàn)放到組里稳强,這樣刪除原因和刪除的文獻(xiàn)數(shù)量就都保留下來了场仲,避免了誤刪。
剩下的復(fù)篩也是類似退疫,通過閱讀摘要和全文渠缕,將文獻(xiàn)分組歸納。最終確認(rèn)納入我們研究的原始文獻(xiàn)褒繁。
三亦鳞、數(shù)據(jù)提取
數(shù)據(jù)提取需要用到的Meta分析軟件,一般就是excel表格啦棒坏。
需要提取的信息有3類:證據(jù)質(zhì)量的信息燕差、證據(jù)的基本信息和結(jié)局指標(biāo)數(shù)據(jù)。根據(jù)PICOS原則設(shè)計好基本信息匯總表后坝冕,從每一篇原始文獻(xiàn)中提取數(shù)據(jù)填入即可徒探。
這里給大家分享一個我私藏的Meta分析軟件——貼心小工具:
StatsTodo。這個網(wǎng)站是一個在線的數(shù)據(jù)提取工具喂窟,可以對多組均值標(biāo)準(zhǔn)差進(jìn)行合并的一個處理测暗。打開網(wǎng)頁央串,輸入數(shù)據(jù),就可以基于Cochrane公式一鍵進(jìn)行合成碗啄,生成合并后的數(shù)據(jù)质和,非常方便,建議大家自己試試挫掏。
四侦另、統(tǒng)計分析出圖
前幾步完成后,就進(jìn)入最核心的數(shù)據(jù)分析環(huán)節(jié)了尉共。
其實Meta分析的數(shù)據(jù)處理就像用洗衣機(jī)一樣簡單褒傅,只要前述步驟按照規(guī)范操作,到了處理這里只需要將Excel里提取的數(shù)據(jù)扔到Meta分析軟件里袄友,Meta分析軟件就會自動出結(jié)果了殿托。
可以做數(shù)據(jù)分析的meta分析軟件有很多,像R語言剧蚣、RevMan支竹、Stata都是比較常用的軟件。
4.1 Meta分析軟件RevMan
RevMan是Cochrane協(xié)作網(wǎng)系統(tǒng)評價的標(biāo)準(zhǔn)化專用軟件鸠按,具備meta分析的大部分功能礼搁,面板式操作,鼠標(biāo)點擊即可完成目尖,操作非常簡單馒吴,適合新手。但是RevMan也有一個很明顯的Bug就是瑟曲,它不能做偏倚回歸圖饮戳,所以建議沒有編程基礎(chǔ)的小白如果選擇RevMan的話一定要結(jié)合其他軟件一起使用。
軟件基本頁面展示:
詳細(xì)的軟件使用教程洞拨,后續(xù)我會給大家出專門的系列文章講解扯罐。
4.2 Meta分析軟件 R語言
R語言,也是Meta分析軟件中非常常用的一款軟件烦衣,基于其開源的特點歹河,在R語言中只需要引入meta程序包就可以開始使用了。
不過R語言是一款程序語言花吟,所以對于新手來說秸歧,可能使用上有一定難度。
用R語言做Meta分析示辈,不僅可以擁有強(qiáng)大的數(shù)據(jù)分析功能寥茫,還能獲得無可比擬的靈活繪圖體驗。雖然要基于代碼進(jìn)行操作矾麻,但是所有代碼函數(shù)基本上都是現(xiàn)成的纱耻,導(dǎo)入數(shù)據(jù)芭梯,簡單修改參數(shù)即可完成!
R語言的安裝:
百度搜索【R語言官網(wǎng)】弄喘,進(jìn)入網(wǎng)站首頁:
在首頁找到藍(lán)色的【download R】:
因為是國外的軟件玖喘,所以下載只能通過鏡像。進(jìn)入鏡像源選擇頁面后蘑志,找到中國的資源鏈接累奈,隨便選擇一個離自己近一點的鏡像:
最后根據(jù)自己的電腦系統(tǒng)版本,下載安裝包即可:
安裝的過程很簡單急但,全程【next】就可以了澎媒。需要提醒一點,安裝路徑最好選擇一個全英文的路徑波桩,最好直接安裝在C盤戒努,這樣可以避免后續(xù)很多不必要的報錯。
4.3 Meta分析軟件 STATA
相較于前兩款镐躲,STATA更像一把瑞士軍刀储玫,體積雖小,功能卻是異常強(qiáng)大萤皂,也是目前Meta分析軟件中最受推崇的軟件撒穷,它能夠完成幾乎所有的Meta分析的統(tǒng)計計算部分。
Stata可以匯總二分類變量裆熙、連續(xù)型變量端礼、診斷試驗、單純P值弛车、劑量反應(yīng)齐媒、生存資料蒲每、Meta回歸纷跛、累計Meta、網(wǎng)狀Meta等等邀杏。
還可以做森林圖贫奠、漏斗圖、拉貝圖望蜡、Galbraith等等唤崭,你能想到的它基本都可以做到。
不過STATA的使用也需要命令操作脖律,所以對于新手來說也有一定的難度谢肾。
解壓壓縮包后,以管理員身份運行安裝包內(nèi)的 SetupStata16.exe
全程點下一步直接安裝即可小泉。
和R語言一樣芦疏,在選擇安裝路徑的時候冕杠,不要讓路徑里存在中文字符,如果你電腦是用自己名字命名的酸茴,默認(rèn)的C盤安裝路徑里可能會有你的名字分预,存在中文字符,這樣就是不行的薪捍。
可以換一個盤笼痹,比如D盤,在D盤里新建一個文件夾命名為stata酪穿,然后把安裝路徑選擇到新建的這個文件夾里凳干。這樣安裝路徑就是D:\stata,這個路徑就是純英文的被济,就可以了纺座。然后等待安裝就可以了。
安裝完成后溉潭,打開軟件輸入激活碼就可以用了~
五净响、結(jié)語
三款軟件各有優(yōu)劣,大家根據(jù)自己的習(xí)慣選擇一兩款進(jìn)行綜合使用即可喳瓣。
meta分析軟件畢竟只是工具馋贤,無論是選擇哪款軟件進(jìn)行Meta分析研究,最終落腳點還是要歸于自己是否真的掌握了系統(tǒng)的meta分析流程畏陕,以及每一個環(huán)節(jié)是否真的按標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行操作配乓。
巧婦難為無米之炊,沒有文獻(xiàn)沒有數(shù)據(jù)惠毁,只懂得如何用軟件犹芹,也是做不出一篇好的文章的。
所以如果你真的想在今年發(fā)表一篇Meta分析的文章的話鞠绰,小編還是建議大家腰埂,可以根據(jù)自己的計劃,安排系統(tǒng)的meta分析學(xué)習(xí)蜈膨,避免因為不規(guī)范的學(xué)習(xí)耽誤研究進(jìn)度屿笼。