R版本更新

系統(tǒng):linux/ubuntu

權限:root權限執(zhí)行

參考網(wǎng)址:Ubuntu Packages For R - Full Instructions (r-project.org)

How to update R 3.x to the new R 4.x in Linux Ubuntu | by Henrique Gomide, Ph.D. | Medium


(1)查看R安裝源版本

看到網(wǎng)上大部分教程都是直接apt install r-base

這里需要注意apt r源版本, apt 安源源在配置文件:/etc/apt/sources.list中幸海,可以定義添加

查看R安源源版本聘裁,代碼如下:? ? ? ? ? ? ? #執(zhí)行其一即可

apt search r-base |grep "^r-base"?

apt policy r-base

?r-base:

Installed:(none)

Candidate: 3.6.3-1bionic

Version table:

3.6.3-1bionic 500

????500 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

????500 http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

3.6.2-1bionic 500

????500 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

????500 http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

3.6.1-3bionic 500

????500 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

????500 http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

3.6.1-1bionic 500

????500 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

????500 http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

3.6.0-2bionic 500

????500 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

????500 http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages

...................


查看

cat /etc/apt/sources.list

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic main restricted

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates main restricted

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic universe

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates universe

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic multiverse

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates multiverse

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-security main restricted

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-security universe

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-security multiverse

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran35/

#deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran40/

deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu/? bionic-cran35/

根據(jù)以上可知道 R安裝源庫版本為cran35, 注意不同ubuntu版本,對應的代號

ubuntu1~18.04:?bionic

Ubuntu 20.04 LTS:?focal

(2)升級 apt R安裝源或者修改R安裝源

方案1:

apt update

apt search r-base |grep "^r-base"?

如果已經(jīng)有目的安裝R版本踊跟,之后直接執(zhí)行安裝代碼

apt install r-base # 建議配合安裝rstudio-server ,而非rstudio

方案2:

sudo vi?/etc/apt/sources.list? #系統(tǒng)文件修改锹淌,需要root 權限

注釋掉bionic-cran35信息行摔吏,添加新的信息源(從官網(wǎng)查找:Ubuntu Packages For R - Full Instructions (r-project.org)

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic main restricted

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates main restricted

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic universe

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates universe

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic multiverse

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates multiverse

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-security main restricted

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-security universe

deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-security multiverse

#deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran35/

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran40/

deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu/? bionic-cran40/

#deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu/? bionic-cran35/

然后apt search r-base |grep "^r-base"? 命令查看apt install r-base

有需要的安裝R版本之后,執(zhí)行安裝命令

如果存在連結(jié)R源庫地址失敗問題米罚,可能是沒有獲得安裝R源網(wǎng)址權限,可以嘗試添加一個權限密鑰:

apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9


(3)升級R包

升級完成后丈探,打開R录择,執(zhí)行以下命令,完成R包的升級

update.packages(ask = FALSE, checkBuilt = TRUE)

?著作權歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
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