Gao L, Gonda I, Sun H, et al (2019) The tomato pan-genome uncovers new genes and a rare allele regulating fruit flavor. Nat Genet 51:1044–1051. https://doi.org/10.1038/s41588-019-0410-2
遺傳多樣性狹窄限制了改良潛力。利用725份具有系統(tǒng)發(fā)育和地理代表性的材料的基因組序列構(gòu)建了番茄泛基因組损搬，發(fā)現(xiàn)參考基因組中缺少4873個基因。存在-缺失變異分析表明，在番茄的馴化和改良過程中秘蛇，基因和啟動子大量缺失及經(jīng)受強烈的負選擇蹬跃。丟失或負選擇的基因會豐富重要性狀而克，尤其是抗病性。在TomLoxC啟動子中發(fā)現(xiàn)了一個罕見的等位基因从诲，該啟動子在馴化過程中被選中。數(shù)量性狀位點定位和對轉(zhuǎn)基因植株的分析揭示TomLoxC在類胡蘿卜素生產(chǎn)中的作用靡羡，這有助于獲得理想的番茄風(fēng)味系洛。在橙色期果實中，含有罕見和常見TomLoxC等位基因（雜合子）的材料的TomLoxC表達高于純合子亿眠，并且在現(xiàn)代番茄中重新出現(xiàn)碎罚。番茄泛基因組增加了參考基因組的深度和完整性，有助于未來的生物發(fā)現(xiàn)和育種纳像。
reveal a role for 揭示作用
resurgent 重新出現(xiàn)
