006-CCA與RDA分析

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RDA分析(Redundancy analysis)赏迟,即冗余分析马僻,對(duì)比主成分分析可以發(fā)現(xiàn),其實(shí)冗余分析就是約束化的主成分分析辛孵。
RDA或CCA的選擇問(wèn)題:RDA是基于線性模型,CCA是基于單峰模型梆造。一般我們會(huì)選擇CCA來(lái)做直接梯度分析洛心。但是如果CCA排序的效果不太好固耘,就可以考慮是不是用RDA分析。RDA或CCA選擇原則:先用species-sample資料做DCA分析词身,看分析結(jié)果中Lengths of gradient 的第一軸的大小厅目,如果大于4.0,就應(yīng)該選CCA法严,如果3.0-4.0之間损敷,選RDA和CCA均可,如果小于3.0, RDA的結(jié)果要好于CCA深啤。


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