安裝R包
鏡像設置
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
安裝
install.packages(“包”) 或者BiocManager::install(“包”)
加載
library(包) 或者require(包)
dplyr的五個基礎函數(shù)
先導入示例數(shù)據(jù)集
test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
新增列 mutate()
mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)
按列篩選 select()
select(數(shù)據(jù)框,1) 篩選第一列
select(數(shù)據(jù)框,c(1,5)) 篩選第一和第五列
select(數(shù)據(jù)框,列名) 按照列名篩選
篩選多個列時
vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")
select(test, one_of(vars))
按行篩選 filter()
filter(test, Species == "setosa")
filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )
filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor"))
排序 arrange()
按照指定列排序蔓腐，默認從小到大
arrange(test, Sepal.Length)
用desc從大到小排序
arrange(test, desc(Sepal.Length))
匯總 summarise()
計算Sepal.Length的平均值和標準差
summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
結(jié)合group_by()分組運算,先按照Species分組肛根，計算每組Sepal.Length的平均值和標準差
summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
符號%>%搂蜓，這是管道操作无畔，其意思是將%>%左邊的對象傳遞給右邊的函數(shù)，作為第一個選項的設置
test %>% group_by(Species) %>% summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
統(tǒng)計某列unique值 count()
count(test,Species)
處理關系數(shù)據(jù)
將2個表進行連接参袱，注意：不要引入factor
（options(stringsAsFactors = F)）
- inner_join(test1, test2, by = "x") 內(nèi)連电谣，以指定列為準取交集
- left_join(test1, test2, by = 'x') 左連，以指定列為準抹蚀，將test2的數(shù)據(jù)補充到test1
- full_join( test1, test2, by = 'x') 全連剿牺，以指定列為準取并集
- semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x') 半連接，返回能夠與y表匹配的x表所有記錄
- anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x') 反連接环壤，返回無法與y表匹配的x表的所記錄
- bind_rows(test1, test2) 合并晒来，需要兩個表格列數(shù)相同
- bind_cols(test1, test3) 合并，需要兩個表格行數(shù)相同
