學(xué)習(xí)小組Day6--劉水水

R包學(xué)習(xí)(dplyr為例)

R包是一系列函數(shù)的合集同波,安裝加載R包后可以通過(guò)調(diào)用別人寫(xiě)好的函數(shù)完成自己的數(shù)據(jù)處理需求

R包安裝

R包的來(lái)源有R的官網(wǎng)(設(shè)置CRAN)和bioconductor這兩個(gè)網(wǎng)站,下載R包也是從這兩個(gè)網(wǎng)站上下載的叠国,所以需要先設(shè)置鏡像未檩,鏡像設(shè)置不好的話(huà)R包下載就會(huì)報(bào)錯(cuò)

鏡像設(shè)置

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #對(duì)應(yīng)清華源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #對(duì)應(yīng)中科大源

options:設(shè)置R的選項(xiàng)設(shè)置
查詢(xún)鏡像來(lái)源的代碼:
options()$repos
options()$BioC_mirror

安裝

install.packages(“包”)#CRAN的包
BiocManager::install(“包”)#Bioconductor的包

加載

library()
require()

dplyr包

安裝并加載dplyr

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
install.packages("dplyr")
library(dplyr)

五個(gè)基礎(chǔ)函數(shù)

mutate()#增加列
select()#篩選列
filter()#篩選行
arrange()#按列排序整個(gè)表格
summarise()

實(shí)用技能

1、管道

%>% #快捷鍵(cmd/ctr + shift + M)

2粟焊、count 統(tǒng)計(jì)某列的unique值

count(test,Species)

dplyr的雙表操作

1冤狡、內(nèi)連接

inner_join(A,B,by = 'C')

2、左連接

left_join(A,B,by ='C')

3项棠、全連接

full_join(A,B,by ='C')

4悲雳、半連接

semi_join(x = A, y = B, by = 'C')

5、反連接

anti_join(x = A, y = B, by = 'x')

6香追、簡(jiǎn)單合并

bind_rows(A,B)
bind_cols(A,B)

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