安裝和加載R包
鏡像設置
1.file.edit('~/.Rprofile')
2.options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #對應清華源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #對應中科大源
3.查看是否配置成功
options()$repos
options()$BioC_mirror
4.安裝R包
install.packages(“包”)或者BiocManager::install(“包”)
**取決于你要安裝的包存在于CRAN網站還是Biocductor击胜，存在于哪里湿颅？可以谷歌搜到
加載
library(包)
require(包)
dplyr五個基礎函數(shù)
mutate(),新增列
select(),按列篩選
1.按列號篩選
select(test,1) ##第一列
2.按列名篩選
vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")
select(test, one_of(vars)) ##調用vars
filter()篩選行
filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 ) ##篩選setosa且Sepal.Length > 5
arrange(),按某1列或某幾列對整個表格進行排序
arrange(test, Sepal.Length)#默認從小到大排序
arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc從大到小
summarise()：匯總
summarise(test, mean(Sepal.Length),sd(Sepal.Length))# 計算Sepal.Length的平均值和標準差
group_by(test, Species)
summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) ## 先按照Species分組项钮，計算每組Sepal.Length的平均值和標準差
dplyr兩個實用技能
管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
count統(tǒng)計某列的unique值
dplyr處理關系數(shù)據
options(stringsAsFactors = F)##注意：不要引入factor
test1 <- data.frame(x = c('b','e','f','x'),
z = c("A","B","C",'D'),
stringsAsFactors = F)
內連inner_join,取交集
左連left_join
left_join(test1, test2, by = 'x')
全連full_join
半連接：返回能夠與y表匹配的x表所有記錄semi_join
反連接：返回無法與y表匹配的x表的所記錄anti_join
簡單合并
在相當于base包里的cbind()函數(shù)和rbind()函數(shù);注意唠倦，bind_rows()函數(shù)需要兩個表格列數(shù)相同刘绣，而bind_cols()函數(shù)則需要兩個數(shù)據框有相同的行數(shù)
