MEGAN6安裝及使用的問(wèn)題

最近接手了一個(gè)宏基因組項(xiàng)目凿傅,做了一段時(shí)間赵哲,已構(gòu)建群體的基因豐度集尿孔,其間遇到的種種問(wèn)題暫且不表俊柔。本以為接著就可以進(jìn)行結(jié)構(gòu)和功能注釋?zhuān)盍税雮€(gè)月終于可以有可視化的結(jié)果了。

結(jié)果活合,還是太天真雏婶,敗在Megan這個(gè)可愛(ài)的程序上。此刻寫(xiě)這篇文章白指,想跟大家探討交流留晚,也希望自己可以借此冷靜。

問(wèn)題:

  1. 軟件linux版本不支持命令行模式
    是的告嘲,作為一個(gè)linux下的軟件错维,它不支持command line mode。能體會(huì)一個(gè)新手小白好容易安裝完然后 -h -v 不管 - 什么都沒(méi)反應(yīng)的絕望嗎橄唬?
  2. 高階版本要付費(fèi)
    高階付費(fèi)版本支持命令行赋焕,官網(wǎng)有30天的試用模式,重點(diǎn)來(lái)了仰楚,點(diǎn)擊申請(qǐng) trial license頁(yè)面就404隆判。我覺(jué)得不是墻的問(wèn)題。
  3. win版超級(jí)卡頓
    試了兩臺(tái)8g電腦卡的死死的僧界,偷偷借了隔壁80g運(yùn)行內(nèi)存的Windows工作站侨嘀,運(yùn)行2.5小時(shí)后卡的一動(dòng)不動(dòng),嚇壞我了怕被抓現(xiàn)形==遂放棄
  4. 舊版本不能運(yùn)行
    我想我需要用的功能很初級(jí)捂襟,megan5應(yīng)該也可以咬腕,然后本地下載-安裝-運(yùn)行,至今都沒(méi)出來(lái)頁(yè)面葬荷。
    這個(gè)軟件的使用說(shuō)明及其難找涨共,論壇資源也很有限纽帖,總之就是困難重重,如果Meta分析發(fā)展的像Chipseq和RNAseq那樣煞赢,該多好抛计。

I'm a northern girl, tall and strong with really bad temper. If I'm not lazy, I will definitely beat the author right on his face.

好了,果然梳理完了之后照筑,恢復(fù)了冷靜吹截,決定刷幾篇文獻(xiàn)cheer up一下。想到解決辦法我會(huì)來(lái)分享凝危。如果你剛好用過(guò)megan波俄,求指教!

5.8 問(wèn)題解決了:
安裝megan6時(shí)最后一步有一個(gè)選項(xiàng):max memorize蛾默,默認(rèn)2g可根據(jù)個(gè)人電腦性能調(diào)整懦铺,我設(shè)成了6g即6000megabase,運(yùn)行幾小時(shí)后成功支鸡。
一開(kāi)始安裝的時(shí)候看到 check updates之類(lèi)的都默認(rèn)跳過(guò)了冬念,所以造成了失誤∧琳酰看來(lái)還是要細(xì)心急前,而且不放棄不抱怨,出了問(wèn)題多從自己身上找原因瀑构,哪怕是認(rèn)為最不可能出錯(cuò)的那一步裆针,往往是解決問(wèn)題的根源。

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