發(fā)簡信
IP屬地：廣東
-
安裝R包devtools遇到的報(bào)錯及解決
記錄一下操禀，也許能幫到一些人 今天安裝devtools包時總是報(bào)錯醋界，提示gert包配置錯誤ERROR: configuration failed ...
-
轉(zhuǎn)錄組全記錄：從rawdata到DEG功能富集
寫在前面：本文是新手學(xué)習(xí)全記錄逢渔，僅供參考热凹，歡迎交流赐俗！ 1. rawdata 1.1 QC 1.2 數(shù)據(jù)量統(tǒng)計(jì) 調(diào)用工具：iTools使用： 2....
-
DESeq2差異分析十全大補(bǔ)使用筆記寫在前面：新手老菜鳥宽闲，個人心得众眨，不足之處歡迎交流指正；寫作不易容诬，轉(zhuǎn)載前請聯(lián)系我征得同意娩梨，謝謝。 1.基本原理 1.1 概述 全稱：DESeq2 ...
-
ggplot2一頁多圖Rmisc-multiplot功能新手排雷
哈览徒，三月是適合寫簡書的月份~這只是一篇短的心得狈定，記錄自己剛剛遇到的問題，供大家參考习蓬。 背景：在用DESeq2做轉(zhuǎn)錄組差異基因纽什，有幾個關(guān)注的mar...
-
Duplication rate：NGS測序重復(fù)率計(jì)算
寫在前面：最近很糾結(jié)于測序數(shù)據(jù)的重復(fù)率，雖然是單細(xì)胞會難免有bias躲叼，但是fastqc和fastp兩款軟件計(jì)算出來的dup%簡直差太大了芦缰，琢磨了...
-
我的RNA-Seq（1）hisat和bowtie比對結(jié)果解讀
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)比對，選用了hisat2枫慷，比對之后發(fā)現(xiàn)結(jié)果不太懂让蕾，于是整理了這篇筆記與大家分享浪规，歡迎交流。 此處是一個轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)hisat2比對結(jié)果探孝，...
-
MEGAN6安裝及使用的問題
最近接手了一個宏基因組項(xiàng)目笋婿，做了一段時間，已構(gòu)建群體的基因豐度集顿颅，其間遇到的種種問題暫且不表萌抵。本以為接著就可以進(jìn)行結(jié)構(gòu)和功能注釋，忙活了半個月終...
-
我的ChIP-Seq(5): peaks注釋
注釋一般有以下幾種方法元镀，但是一般經(jīng)驗(yàn)有： 1.比對時下載UCSC格式的參考基因組绍填，后續(xù)操作障礙少2.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備要嚴(yán)格按照軟件的說明，若遇到格式正確...
-
我的ChIP-Seq(4):MAnorm差異分析哈哈栖疑，搜了一圈沒發(fā)現(xiàn)網(wǎng)上有關(guān)于MAnorm的中文教程或者是說明讨永，本文將是第一篇~撒花??ヽ(°▽°)ノ?那就要用心寫了，感到鴨梨.jpg== 首...