核酸測(cè)定是家常便飯,但是測(cè)定的儀器不同竣灌,濃度差別很大聂沙。最近送樣測(cè)序,自己的nanodrop測(cè)濃度非常高初嘹。但是Qubit測(cè)定后濃度特別低及汉。
從原理分析兩者:
nanodrop是基于吸光值來(lái)計(jì)算核酸濃度,當(dāng)核酸里面有污染時(shí)屯烦,濃度就會(huì)相差很大坷随。
比如:我送的DNA里面有RNA污染房铭,用nanodrop測(cè)序濃度是都是500ng/ul以上,但是使用 Qubit測(cè)定后温眉,濃度低到10以下缸匪。
nanodrop對(duì)于低于20ng/ul的樣品濃度測(cè)定非常不準(zhǔn)確。
常見(jiàn)的切膠回收的濃度非常低类溢,nanodrop測(cè)定的一般不可靠凌蔬。
在樣品里面核酸純度比較高,且濃度相對(duì)較高時(shí)闯冷,nanodrop和Qubit的濃度差距不大砂心。
使用試劑盒提取的核酸一般純度較高。
nanodrop測(cè)定核酸時(shí)蛇耀,根據(jù)溶解的液體pH值不同辩诞,A260/A280有所差異 。
當(dāng)溶解在ddH2O中時(shí)蒂窒,呈酸性躁倒,A260/A280值可能會(huì)低于1.8,在1.5-1.8洒琢,這也是正常情況秧秉。
使用pH=8的TE溶解時(shí),A260/A280值可能偏大衰抑。
Qubit是基于 染料法象迎,結(jié)合特異的核酸,只結(jié)合DNA或RNA,但是對(duì)溫度敏感呛踊,需要標(biāo)液砾淌。