9月11日：

看到各位同學(xué)精彩的發(fā)言豆挽，非常過癮充甚，也來分享一下我的觀點(diǎn)：

1. “ 首先，我們感受到的所謂目的性鞭执，無非是復(fù)雜系統(tǒng)運(yùn)行中呈現(xiàn)出來的假象罷了司顿。”

立銘老師講到了復(fù)雜系統(tǒng)兄纺，前邊同學(xué)也提到克萊伯定律大溜，提到了杰弗里韋斯特的《規(guī)模》估脆，個(gè)人也特別推崇用數(shù)學(xué)物理方法來解釋理論钦奋，我想進(jìn)化論也需要用數(shù)學(xué)和物理方法來解釋或者闡述。

2. 之前看到一句話：“適者生存疙赠，而不是強(qiáng)者生存”付材，很有味道，分享出來圃阳。

最后有一些疑問厌衔，可以一起探討：

1. 從神創(chuàng)論到進(jìn)化論：把神創(chuàng)論逼到角落或者請(qǐng)下神壇的個(gè)人感覺應(yīng)該是物理學(xué)

2.機(jī)器視角到廣場(chǎng)視角的轉(zhuǎn)變，我覺得應(yīng)該承認(rèn)物理學(xué)的貢獻(xiàn)捍岳，同時(shí)強(qiáng)調(diào)進(jìn)化論富寿，課程中細(xì)品的話，有點(diǎn)把牛頓和拉普拉斯放到進(jìn)化論的對(duì)立面了锣夹，我覺得應(yīng)該是一個(gè)體系页徐。

以上一些淺見，歡迎碰撞晕城，如有不對(duì)之處泞坦，請(qǐng)指正[抱拳][抱拳]

9月12日：

關(guān)于涌現(xiàn)，分享一下元胞自動(dòng)機(jī)原理砖顷，有助于認(rèn)識(shí)涌現(xiàn)理論

所以生命進(jìn)化也可以用系統(tǒng)論的方法來研究

廣義上的進(jìn)化論贰锁，沒有局限在生物領(lǐng)域，很有意思的拓展

9月13日：

看完今天的內(nèi)容滤蝠，引發(fā)了我的一些思考：測(cè)算進(jìn)化論的研究尺度:

1.時(shí)間尺度：35億年前至今（地球誕生于大概45億年前豌熄，生命大概誕生于35億年前）

2.空間尺度：分子尺度～地球尺度（10^-10m—1.3*10^7m）

3.溫度范圍：生命存在的最高溫度和最低溫度（最高約400℃（生活在海底火山附近的生物）,最低2k（一種細(xì)菌 ）

4.氣壓范圍：還沒搜到確切

范圍

其他尺度，歡迎補(bǔ)充

范高華補(bǔ)充：生物量的空間尺度物咳，現(xiàn)在最新的研究結(jié)果是從最小的海洋微生物10^-13g到最大的生物體10^8次方g锣险，一共能橫跨21個(gè)數(shù)量級(jí)

如果給進(jìn)化論起個(gè)文藝點(diǎn)的名字的話，是不是應(yīng)該叫——地球上的那些事兒[破涕為笑]

有可能，我在頭條上搜的芯肤，沒有實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證

學(xué)完今天的關(guān)于可遺傳變異的兩節(jié)課程巷折，好奇不同生物之間基因突變率的分布，頭條找了點(diǎn)資料：

基因突變率 genemutationrate在自然狀態(tài)下崖咨，對(duì)一種生物來說锻拘，基因突變的頻率是很低的。

據(jù)估計(jì)击蹲，在高等生物中署拟，大約十萬個(gè)到一億個(gè)生殖細(xì)胞中，才會(huì)有一個(gè)生殖細(xì)胞發(fā)生基因突變歌豺，突變率是10^-5～10^-8推穷。不同生物的基因突變率是不同的。例如类咧，細(xì)菌和噬菌體等微生物的突變率比高等動(dòng)值物的要低馒铃。同一種生物的不同基因，突變率也不相同轮听。例如骗露，玉米的抑制色素形成的基因的突變率為1.06×10^-4，而黃色胚乳基因的突變率為2.2×10^-6.

9月14日：

看完今天的內(nèi)容血巍，想起以前看過的關(guān)于生物學(xué)版——愛在西元前萧锉，轉(zhuǎn)載一下

生物學(xué) 1

達(dá)爾文作下了〈物種起源〉承印在麥克米倫出版社， 距今已經(jīng)一百四十多年述寡。

布朗與哥斯丁柿隙，凝視低密度脂蛋白接受體， 孟德爾卻在旁靜靜培植他那片深愛的豌豆鲫凶。

性狀禀崖，倍體，端粒螟炫，代謝是誰的發(fā)現(xiàn)波附？

喜歡在染色體中你只屬于我的那個(gè)堿基對(duì)， 經(jīng)過劍橋克萊爾學(xué)院昼钻，我以沃森掸屡、克里克之名許愿， 思念像基因雙螺旋般蔓延然评， 當(dāng)傳導(dǎo)只剩下單離子通道仅财，遞質(zhì)就成了永垂不朽的詩篇。

我給你的愛寫在脫氧核苷酸上碗淌，深埋在嘌呤嘧啶里面盏求， 幾十個(gè)世紀(jì)后出土發(fā)現(xiàn)抖锥，CATG配對(duì)原則依然清晰可見。

用光合作用去驗(yàn)證頂端優(yōu)勢(shì)碎罚，那已被人遺忘的反饋調(diào)節(jié)磅废， 一切又重演

生物版 2

麥克林道格發(fā)現(xiàn)了轉(zhuǎn)座因子躍遷

縱然碎成岡崎片段

我的心也決不那么善變

滾滾紅塵間

抗體尋覓著抗原

你的靈魂是唯一使我沖動(dòng)的乙酰膽堿

退火 延伸 克隆 突變

是誰的實(shí)驗(yàn)

女神的創(chuàng)世紀(jì)沒有適者生存的字眼

聽完古多爾的講演

我以猩猩之名許愿

常溫習(xí)你蘇丹Ⅲ般燦爛容顏 倒一塊思念的板忘了加氨芐 寂寞像雜菌空氣里四處蔓延 我給你的愛寫在西元前

深埋在三葉蟲和恐龍身邊

就算第四紀(jì)的冰期再出現(xiàn)

兩只手用肽鍵依然緊緊相牽 我給你的愛寫在西元前

深埋在三葉蟲和恐龍身邊

用看家基因表達(dá)出永遠(yuǎn)

每個(gè)核苷酸都記載下我們的誓言

期待那么一天

愛欲升騰著火焰

兩個(gè)人

交織纏繞成雙螺旋

生命版 3

沃森和克里克留下了雙螺旋模型，

現(xiàn)代生命科學(xué)誕生荆烈，

距今已經(jīng)擁有五十余年还蹲。

連鎖交換律，

天才的偉大斷言耙考，

我卻一直希望我們的連鎖不會(huì)有改變。

表達(dá)潭兽，解旋倦始，遺傳，突變是誰的發(fā)現(xiàn)山卦？

喜歡你在配對(duì)中聯(lián)會(huì)屬于我的雙鏈鞋邑。

經(jīng)過巴斯德研究院，

我以大師之名許愿账蓉，

思念像回文序列一樣的漫延枚碗。

當(dāng)DNA只剩下復(fù)制的起點(diǎn)， 合成就成了永垂不朽的詩篇铸本。

我給你的愛寫在GC鍵肮雨，

卓越的穩(wěn)定性不需我多言， 即使剪切作用仍會(huì)發(fā)現(xiàn)箱玷，

我們間的氫鍵依然清晰可見怨规。

我給你的愛寫在GC鍵,

點(diǎn)綴在每一對(duì)核苷酸之間

用中心法則寫下了永遠(yuǎn)

那一反向轉(zhuǎn)錄的經(jīng)典，

一切又重演

我感覺很疲倦锡足，

你的座位仍很遠(yuǎn)波丰，

害怕永不能轉(zhuǎn)座到你身邊。 愛在堿基間…… 愛在堿基間……

QQ個(gè)人說明：

我給你的愛寫進(jìn)核苷酸

深埋在皮層內(nèi)每個(gè)神經(jīng)元

硫35雜交探針后發(fā)現(xiàn)　　?

鉛板上的放射依然清晰可見

我給你的愛寫進(jìn)多肽鏈

深埋在蛋白折疊的疏水面

用尿嘧啶完成的點(diǎn)突變　　

那已凍干千年的Ep管

提質(zhì)粒又重演…

9月15日：自然對(duì)達(dá)爾文說：請(qǐng)不要代替我做選擇

9月19日提問：進(jìn)化論目前看是從過去收集到的證據(jù)歸納出來的舶得，我的問題是掰烟，進(jìn)化論具備預(yù)測(cè)能力嗎？如果有沐批，那有哪些預(yù)測(cè)性的結(jié)論纫骑？謝謝

17.馬太效應(yīng)與復(fù)雜器官

【收獲】復(fù)利效應(yīng)應(yīng)用在器官形成和生物多樣性的解釋領(lǐng)域，很有說服力珠插。

【問題】眼睛的1.0版本到5.0版本之間有沒有確鑿的證據(jù)表明系出同源惧磺？眼睛的6.0甚至更高的版本會(huì)是什么樣的？

18.進(jìn)化不是鐘表匠而是裱糊匠

【收獲】

1.精確度越高捻撑，魯棒性越差磨隘，所以生物進(jìn)化的形態(tài)是模糊正確缤底，保證了穩(wěn)定性。

2.進(jìn)化是受資源約束番捂，生物進(jìn)化是生存與繁殖的平衡

3.基因連鎖：有福禍相倚个唧，陰陽相伴的味道

【問題】雄孔雀的尾巴是自然選擇的正確結(jié)果嗎？

19｜路徑依賴：為什么歷史經(jīng)驗(yàn)會(huì)成為歷史包袱设预？

【收獲】

1.優(yōu)勢(shì)也具有反身性：成就你的同樣也會(huì)限制你徙歼。運(yùn)用到商業(yè)領(lǐng)域就是創(chuàng)新者的窘境，運(yùn)用到心理學(xué)領(lǐng)域就是知識(shí)的宇宙

2.不可回避的路徑依賴：馬的體型如何決定了太空探測(cè)器的尺寸鳖枕。醫(yī)學(xué)領(lǐng)域就有——你是你吃出來的

【一點(diǎn)小疑問】關(guān)于四足肉鰭魚上岸這節(jié)魄梯，是四足肉鰭魚上岸恰巧活了下來，還是五足宾符，六足直到N足都上岸了酿秸，只是四足活下來了？這個(gè)問題還挺關(guān)鍵魏烫，前者是隨機(jī)事件辣苏，后者是四足在陸地更具生存力，是個(gè)更適應(yīng)事件哄褒，請(qǐng)幫忙解答稀蟋，謝謝

20｜死亡和滅絕：進(jìn)化何時(shí)會(huì)終止？

【收獲】

1.從邏輯上說呐赡，既然自然選擇關(guān)注的是什么生物能夠成功的生存下來退客，直到繁殖后代，那它能夠影響的就只是生物在繁殖完成之前體現(xiàn)出來的那些特征链嘀【迹——極其精彩的洞察。

2.人類男性的睪丸酮的作用

3. 一個(gè)物種越成功管闷，就越特化粥脚；越特化，就越無法抵抗環(huán)境波動(dòng)包个，于是物種的滅絕就成了必然刷允。——穩(wěn)定性與復(fù)雜度反相關(guān)碧囊。

【一些小疑問】

1.如何解釋活化石類生物到現(xiàn)在仍然存活树灶？是因?yàn)樗鼈儧]有特化嗎？

2.水螅和某些水母永生的機(jī)理可否展開講講糯而？謝謝老師[玫瑰][玫瑰][玫瑰]

21｜低熵狀態(tài)：秩序?yàn)楹问巧那疤幔?br>

【收獲】負(fù)熵為生? 孤立系統(tǒng)走向熵增天通，開放系統(tǒng)有與外部進(jìn)行物質(zhì)和能量交換，可以使自身熵減熄驼，生命就是這樣的熵減系統(tǒng)像寒。

【思考與疑問】嘗試定量計(jì)算生命系統(tǒng)的熵和熵減烘豹，不同生物的熵有何不同？熵減有何差異诺祸？生命系統(tǒng)在與外部世界交換物質(zhì)和能量的同時(shí)也交換信息携悯，生命系統(tǒng)的信息熵如何分布？

22｜能量：秩序的源泉是什么筷笨？

【收獲】

1.生命系統(tǒng)使用的ATP和ADP的方式使用能量憔鬼，它的優(yōu)勢(shì)是什么

2.為什么使用這種方式使用能量？有沒有其他方式胃夏？

【疑問】化學(xué)滲透方式合成ATP真的是一種冗余嗎轴或？

23｜信息：秩序如何穩(wěn)定傳承？

【收獲】DNA如何實(shí)現(xiàn)信息傳遞的：

1.代際傳遞和信息載體到生命活動(dòng)的信息傳遞仰禀；

2.一維的信息載體如何傳遞三維信息:利用了氨基酸的折疊特性

【疑問】意識(shí)的產(chǎn)生也依賴生命的結(jié)構(gòu)嗎侮叮？必須依賴這種結(jié)構(gòu)嗎？

24｜繼承：生命的底層約束條件是什么悼瘾？

【收獲】

1.ATP形成猜想

2.曾經(jīng)的“王者”——RNA

【疑問】

1. 在熱泉附近，“水壩”是現(xiàn)成的审胸，而“抽水機(jī)”是不必要的亥宿，于是我們就完全可以設(shè)想，只要出現(xiàn)一個(gè)水力發(fā)電機(jī)的雛形砂沛，鑲嵌在“水壩”上面烫扼，生命活動(dòng)所需的能量載體ATP就可以被源源不斷的制造出來。

水力發(fā)電機(jī)是由于熱泉附近豐富的環(huán)境隨機(jī)產(chǎn)生的嗎碍庵？

2.RNA比DNA早出現(xiàn)多長(zhǎng)時(shí)間映企？

25｜生育繁殖：選擇效率，還是可能性静浴？

【收獲】

1. 有性繁殖：犧牲效率堰氓，儲(chǔ)備可能。

2.生物界：效率與可能均衡

【問題】以效率為繁殖的生物與以可能性為繁殖方式的生物勢(shì)均力敵苹享，是從哪個(gè)角度來衡量的双絮？肯定不是個(gè)體數(shù)量。

26｜生活史規(guī)劃：選擇多生得问，還是善養(yǎng)囤攀？

【收獲】生物在多生和善養(yǎng)角度，總是保證多樣性宫纬，這樣便能最大可能的生存下來

焚挠。

27｜適應(yīng)輻射：生物的多樣性如何增長(zhǎng)？

【收獲】

1.通過“奠基者-沖刷-選擇”三個(gè)步驟漓骚，就能實(shí)現(xiàn)新生物學(xué)特性和新物種的快速形成蝌衔。

關(guān)于沖刷效應(yīng)的計(jì)算令人耳目一新

2. 關(guān)于寒武紀(jì)大爆發(fā)的原因猜想：HOX（同源異形）基因的出現(xiàn)與眼睛在寒武紀(jì)之前形成榛泛，很有想象力和解釋力。

【問題】

1.HOX基因希望能夠更深入的展開介紹胚委，比較感興趣

2.眼睛形成于寒武紀(jì)之前有什么樣的化石證據(jù)挟鸠？

28｜相愛相殺：不同生物之間如何相處？

【收獲】

1.生存競(jìng)爭(zhēng)導(dǎo)致生態(tài)位分離亩冬，從而形成了生物的多樣性艘希，從而享受多樣性紅利

2. 掠奪關(guān)系最終有益于掠奪者和被掠奪者雙方

3.共生關(guān)系：始于利益，成于懲罰硅急，終于共贏

【問題】懲罰也是自然選擇的結(jié)果覆享，有什么樣的證據(jù)支持？

29｜負(fù)反饋：生物如何應(yīng)對(duì)環(huán)境波動(dòng)营袜？

【收獲】生命系統(tǒng)中的負(fù)反饋的生物學(xué)機(jī)理：

1.對(duì)抗環(huán)境條件的偶然波動(dòng)撒顿，維持生物體某些指標(biāo)的穩(wěn)定性。

2.針對(duì)環(huán)境中周期性的波動(dòng)產(chǎn)生相對(duì)應(yīng)的周期性荚板。案例是生物體內(nèi)的時(shí)鐘機(jī)制凤壁，剛獲過諾獎(jiǎng)。

30｜正反饋：生物如何進(jìn)行狀態(tài)切換跪另？

【收獲】生物系統(tǒng)的兩類正反饋：

1.幫助生物感知和放大微弱但重要的信號(hào)拧抖，完成狀態(tài)切換,案例——有絲分裂。

2.幫助生物體識(shí)別意外風(fēng)險(xiǎn)免绿，啟動(dòng)應(yīng)急補(bǔ)救措施,案例——凝血機(jī)制唧席。

【感悟】生命中的正反饋與負(fù)反饋，互相配合嘲驾，保證生命的航船生生不息淌哟，平穩(wěn)向前，精妙的設(shè)計(jì)辽故。

31｜前饋系統(tǒng)：生物如何與時(shí)間共舞徒仓？

【收獲】生命體中的前饋系統(tǒng)：一致性前饋和非一致性前饋的機(jī)理。

王老師一定學(xué)過信號(hào)與系統(tǒng)誊垢，才能用信號(hào)的語言把生物學(xué)的信號(hào)同路講的如此清晰蓬衡，佩服佩服。

32｜監(jiān)察修復(fù)：生物如何應(yīng)對(duì)常見挑戰(zhàn)彤枢？

【收獲】

生命體如何抵御“灰犀耪恚”式的風(fēng)險(xiǎn)，即大概率的風(fēng)險(xiǎn)：

【監(jiān)察和修復(fù)的方法論】

1.就地發(fā)現(xiàn)缴啡，就地處理壁晒。將風(fēng)險(xiǎn)由十萬分之一降低至千萬分之一

2.面對(duì)實(shí)在無法克服的挑戰(zhàn)時(shí)，可以繞行业栅∶敫溃“DNA錯(cuò)配修復(fù)”谬晕，能把DNA復(fù)制的錯(cuò)誤率再降低三個(gè)數(shù)量級(jí)，達(dá)到驚人的百億分之一携取。

【止損系統(tǒng)的方法論】

1.干脆把細(xì)胞整個(gè)生命活動(dòng)暫停攒钳，專心修復(fù)損傷，防止把DNA錯(cuò)誤傳遞給子孫后代雷滋。

2.干脆啟動(dòng)自殺程序不撑，防止把DNA錯(cuò)誤傳遞給子孫后代。當(dāng)然晤斩，這個(gè)策略主要是針對(duì)多細(xì)胞生物來說的焕檬。

【感悟】到這里我已經(jīng)說不出什么了，能理解就不錯(cuò)了澳泵。生命已經(jīng)像上了大學(xué)的孩子实愚，輔導(dǎo)不了了[捂臉]

35｜終極武器：怎樣用進(jìn)化對(duì)抗進(jìn)化？

【收獲】

在物理和化學(xué)世界的變化之外兔辅，地球生物需要面對(duì)的是其他生物的存在和持續(xù)變化腊敲。和發(fā)生在物理、化學(xué)世界的變化不同维苔，生物的變化是被進(jìn)化持續(xù)驅(qū)動(dòng)的碰辅，速度和尺度都可以非常驚人。想要應(yīng)對(duì)它蕉鸳，可能唯一的辦法就是啟動(dòng)自身的進(jìn)化，用進(jìn)化對(duì)抗進(jìn)化忍法。

1.天然免疫：微生物和人體之間幾乎所有的系統(tǒng)性差別都會(huì)被天然免疫系統(tǒng)加以利用潮尝，來區(qū)分?jǐn)澄摇?/p>

2.抗體的誕生——進(jìn)化對(duì)抗進(jìn)化

案例： B細(xì)胞的進(jìn)化

3.細(xì)菌的免疫系統(tǒng)：上帝的手術(shù)刀

案例：CRISPR cas9

【感悟與心得】王老師高屋建瓴的講述了人體免疫系統(tǒng)的工作原理，深入淺出的科普了B細(xì)胞工作原理和CRISPR cas9技術(shù)饿序，非常過癮勉失，感謝感謝！

36｜復(fù)雜系統(tǒng)：進(jìn)化的最終歸宿是什么原探？

【收獲】生命為什么會(huì)走向復(fù)雜乱凿？

1.生命的進(jìn)化固然充滿隨機(jī)性，但也有一個(gè)無法繼續(xù)簡(jiǎn)化的最小單元咽弦、一堵無法突破的墻徒蟆，就是細(xì)菌這樣的單細(xì)胞生物。

2.地球上可能始終是細(xì)菌這類簡(jiǎn)單生物的數(shù)量最多型型，但也會(huì)逐漸出現(xiàn)越來越復(fù)雜的生命形態(tài)段审，讓地球生物的平均復(fù)雜程度逐漸提高。

3.當(dāng)一個(gè)系統(tǒng)的復(fù)雜程度上升闹蒜，對(duì)稱性持續(xù)地被破壞寺枉，新的定律抑淫、概念和原理都會(huì)必然出現(xiàn)。

【心得與感悟】

1.之前我關(guān)于生命越來越復(fù)雜的疑問在這里被解開了姥闪。

2.非常贊同隨著復(fù)雜度的提升新的理論會(huì)出現(xiàn)始苇。

3.期待下一講，新的理論

感覺自然選擇這個(gè)說法不夠準(zhǔn)確筐喳，舉一個(gè)不全恰當(dāng)?shù)睦樱河袃蓚€(gè)小盆友用身體穿過一個(gè)間距一定的柵欄催式，其中一個(gè)小盆友瘦一些鉆過去了，另外一個(gè)小盆友胖了點(diǎn)鉆不過去疏唾。

這個(gè)時(shí)候蓄氧，我們說這個(gè)柵欄選擇了瘦的小盆友。

這個(gè)表述準(zhǔn)確嗎槐脏？

柵欄：憑什么說我選擇了喉童？

很顯然，選擇這件事情是我們認(rèn)為的顿天，或者說是我們強(qiáng)加給柵欄的

那么堂氯，進(jìn)化論是不是只是一種表述方法，或者敘事方法牌废。

終于找到了

尼采的說法

尼采認(rèn)為咽白，“存在一個(gè)客觀真相”，只不過是一廂情愿的假設(shè)鸟缕。沒有任何人能確定是否存在這個(gè)所謂的“客觀真相”晶框。如果說有誰能看到這個(gè)絕對(duì)的客觀真相，那只能是全知全能的上帝懂从。但別忘了授段，上帝已經(jīng)“死了”。不管怎樣番甩，人類不可能確定存在一個(gè)絕對(duì)真相侵贵。人能得到的，就是一個(gè)個(gè)不同的視角看到的不同真相缘薛。更準(zhǔn)確地說窍育，人不是“看到”真相，而是“制造”了真相宴胧。

這是什么意思呢漱抓？

在尼采看來，外部世界雖然是存在的恕齐，但在人出現(xiàn)之前辽旋，它沒有任何意義，也沒有任何屬性，只是一團(tuán)混沌而已补胚。是人把概念和意義賦予到它上面码耐，才讓它變成了“事物”。

37｜分工與協(xié)作：怎樣實(shí)現(xiàn)個(gè)體能力的有效疊加溶其？

【收獲】

1.細(xì)胞分化的過程很有意思

2.細(xì)胞間的合作提升了效率骚腥，也實(shí)現(xiàn)了單細(xì)胞無法實(shí)現(xiàn)的功能增加

【思考】如果沒有特殊的環(huán)境，細(xì)胞是不是就不會(huì)分化瓶逃？

38｜對(duì)抗與博弈：如何解決組織內(nèi)部的利益分歧束铭？

【疑問】

1. 當(dāng)分子構(gòu)成了細(xì)胞之后，分子和細(xì)胞的利益就不完全一致厢绝。為什么契沫？能舉出分子和細(xì)胞利益不一致的例子嗎？利益在此的用法是否足夠準(zhǔn)確昔汉？為什么懈万？

2.在細(xì)胞堆積、形成多細(xì)胞生物這個(gè)新的層次之后靶病，細(xì)胞和多細(xì)胞個(gè)體之間也會(huì)出現(xiàn)利益的不一致会通。單細(xì)胞和多細(xì)胞所謂的利益是什么？

3.細(xì)胞和組織的重復(fù)博弈娄周，有證據(jù)支持嗎涕侈？是什么？