1 GWAS的目錄
歷史
來自 (ss)GBLUP
單SNP回歸
求解SNP效應(yīng)使用
GWAS的一些細(xì)節(jié)
2 遺傳評估中的非加性效應(yīng)
來自Zulma G. Vitezica(INPT/INRAE)
生物效應(yīng)(biological effects) VS 統(tǒng)計效應(yīng)(statistical effects)
生物效應(yīng)-顯性或上位效應(yīng)
? 不幸的是肠缔,我們并不了解所有的基因作用和通路
? 出于多種目的变隔,我們需要做出假設(shè)/定義理論
統(tǒng)計效應(yīng)(statistical effects)
顯性效應(yīng)本質(zhì)上是殘差
兩對的上位效應(yīng)例子
統(tǒng)計和生理效應(yīng)
數(shù)量性狀的遺傳結(jié)構(gòu)不能從方差分量分析中推斷出來
? 基因的生物上位作用有助于加性和其他遺傳變異成分
? 基因作用的種類和方差分量之間沒有對應(yīng)關(guān)系。
這些數(shù)學(xué)公式能夠起到什么作用呢轿偎?
在不知道真正的作用基因的情況下广凸,這提供了工具
包含非加性效應(yīng)的模型GDBLUP及其延伸正在發(fā)展中
非加性效應(yīng)的遺傳評估:
開始之前的準(zhǔn)備:
還有的關(guān)系矩陣:
非加性效應(yīng)的遺傳評估在雜交作物中:
近交衰退 / 雜種優(yōu)勢
Runs of homozygosity (ROHs)
可能的用途
但是前兩種不好
豬上的例子
肉牛上的例子
小結(jié)
第三種作用-選配
豬上的例子(相同品種)
交配的分配:
小結(jié)
豬上的例子(不同品種)
豬的遺傳提高
選配結(jié)論
然而阅茶,模擬 F1 雜交(豬)中的交配程序并沒有產(chǎn)生額外的性能